CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = G15S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B15G15SG3278SnonsynGgtAgt26017260160.99996210097-10099
ORF1ab/nsp5A-B15G15SG3278SnonsynGgTAgC2601710.000038436410097-10099

Details of the mutation G15S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2601626017All0.004976
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgTAgC126017All0
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt84648464C.370.982358
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt29692969B.1.1.10.969944
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22302230B.1.1.3690.995091
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt17091709C.36.30.96937
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt13721372B.1.1.3720.944904
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt12061206C.350.933437
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt10171017C.360.92623
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt914914C.160.969247
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt578578C.300.998273
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt449449AY.40.000699
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt399399C.10.954545
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt380380C.180.984456
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt357357C.36.3.10.970109
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt347347C.37.10.908377
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt240240C.36.10.995851
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt231231C.141
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt224224C.81
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt222222C.1.20.944681
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt170170C.230.988372
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt161161B.10.001475
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt150150C.2.11
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt149149C.30.11
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt139139C.121
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt136136C.261
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt131131C.31
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt116116C.380.935484
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt9898C.40.98
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt9494C.111
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt8989B.1.10.001615
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt7676B.1.2580.005058
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt6767B.1.1.3750.797619
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt6262C.21
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt5959B.1.1.2050.219331
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt5656C.311
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt5454C.271
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt4949C.390.924528
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt4343C.321
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3939C.131
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3737C.191
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3636C.401
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3535B.1.3510.00104
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3333B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3232C.90.969697
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt3030AY.30.000298
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2929C.71
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2828C.36.20.965517
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2727C.341
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2626C.60.962963
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2525B.1.617.20.000094
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2525C.281
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2323B0.00294
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt2020B.1.214.20.01199
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1717C.331
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1616B.1.177.400.082474
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1414C.170.777778
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1414C.221
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1414C.290.875
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1313AY.1030.000081
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1313C.201
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1212AY.9.20.000441
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1212B.1.20.000106
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1212C.1.10.923077
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt1111C.51
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt88C.251
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt77AY.430.000031
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt77B.1.160.300.020833
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt77B.1.177.230.022654
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt77B.1.230.042424
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt77C.211
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt66AY.330.000401
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt66B.1.5170.002562
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt55B.1.1.2940.006329
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt55B.1.1.3480.003981
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt55B.1.1600.000156
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt55B.1.5240.007032
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt44B.1.1.2200.007435
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt44B.1.1.4480.00813
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt44C.101
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt230.111111
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgTAgC130.055556
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt33AY.180.030303
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt33B.1.1.4090.008499
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22A0.000774
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.420.00008
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.620.000871
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22AY.670.000929
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.1.5260.007092
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.1.830.00542
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.1700.008621
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.3710.002245
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22B.1.810.042553
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11A.20.000662
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AH.20.012048
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AK.10.012658
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.930.000273
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.3240.052632
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.3790.03125
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1.520.012195
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.177.840.006667
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.221.30.000833
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.4650.003802
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.4660.023256
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.5440.006024
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.5540.004405
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11N.40.004255
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11N.60.007092
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11P.10.000016
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11P.1.40.000977
ORF1ab/nsp5A-B15G15SGgtAgt11Q.70.001111