CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = G15C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B15G15CG3278CnonsynGgtTgt13631363110097-10099

Details of the mutation G15C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt13631363All0.000261
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11951195B.1.221.30.995833
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt3636AY.420.001448
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt2222B.1.20.000194
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt88AY.1000.000368
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt77AY.200.000272
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt77AY.430.000031
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt77B.10.000064
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt77B.1.6090.003356
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt55D.20.000375
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt33AY.40.000005
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt220.111111
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt22R.10.00018
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11A.10.000282
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.177.840.006667
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp5A-B15G15CGgtTgt11B.1.621.10.000506