CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = F140del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B140F140delF3403deldelTTC---7979110472-10474

Details of the mutation F140del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---7979All0.000015
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---3333AZ.20.027094
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---1717B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---660.333333
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---33AY.40.000005
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---22AY.700.000417
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---22B.1.1.510.003436
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B140F140delTTC---11N.40.004255