CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : Mut = A129V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B129A129VA3392VnonsyngCtgTt573057130.99703310439-10441
ORF1ab/nsp5A-B129A129VA3392VnonsyngCTgTG5730100.001745210439-10441
ORF1ab/nsp5A-B129A129VA3392VnonsyngCTgTC573040.0006980810439-10441
ORF1ab/nsp5A-B129A129VA3392VnonsyngCTgTA573030.0005235610439-10441

Details of the mutation A129V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt57135730All0.001093
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTG105730All0.000002
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTC45730All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTA35730All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt25602560AY.40.003984
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt373373B.1.1.70.000334
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt304304AY.250.001829
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt299299B.1.617.20.001126
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt248248AY.440.00151
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt194194AY.430.00086
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt184184B.1.177.800.351816
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt136138B.1.20.001198
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTG2138B.1.20.000018
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt124124AY.1030.00077
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt7474B.1.1.550.961039
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt6969AY.1020.001829
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt5252AY.1190.001836
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt4051B.10.000366
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTG751B.10.000064
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTA251B.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTC251B.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt4646B.1.1770.000606
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt4444B.1.177.600.009611
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt4040B.1.10.000726
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt3636AY.390.00089
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt2626AY.640.015476
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt2525AY.1000.00115
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt2424AY.4.20.000521
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt2020B.1.1.5190.000794
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt2020P.10.000315
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1919AY.330.001269
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1919AY.980.001501
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1818AY.1200.000669
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1818AY.30.000179
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1818B.1.177.810.003408
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1717B.1.177.40.003588
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1616AY.260.000453
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1616AY.290.000252
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1616B.1.1.370.003086
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1616B.1.4290.000376
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1515AY.470.000467
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1414B.1.617.10.001806
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1313AY.410.003821
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1313AY.420.000523
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1313AY.98.10.00063
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1313B.1.1.2840.001396
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1313B.1.3510.000386
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1212AY.50.000248
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1012B.1.1600.000312
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTG112B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTC112B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1111B.1.1.3040.030899
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1111B.1.2210.000781
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1010B.1.1.890.060606
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt810B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTA110B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCTgTC110B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1010B.1.5260.000235
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt1010C.36.30.005672
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt99AY.200.00035
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt99AY.4.2.10.001341
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt88AY.46.60.000578
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt88AY.610.000838
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt88AY.620.003486
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt88AY.850.003417
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt88B.1.5750.002427
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt77AY.1170.000592
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt77AY.270.000453
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt77B.1.2400.001509
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt77B.1.5960.00061
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt66A.2.50.002994
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt66AY.460.000624
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt66B.1.5770.004124
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.350.001165
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.450.000608
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.60.000206
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55AY.910.003652
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55B.1.177.210.000382
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55D.20.000375
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55P.1.120.00242
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55P.20.000933
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt55R.10.00045
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.1180.000251
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.230.000279
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.540.000381
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.690.000747
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.750.000224
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.840.00175
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44AY.90.00027
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44B.1.1.5260.014184
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44B.1.3060.022857
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44B.1.351.20.00121
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt44Q.10.000505
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33AY.300.001187
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33AY.950.002283
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.1.2970.006711
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.1.4320.003797
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.3490.002144
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.428.10.103448
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.100.00106
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.160.000759
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.20.000712
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.590.001059
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.730.001331
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.740.000231
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.880.001768
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.900.001369
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.920.000575
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B0.000256
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.1.1760.000879
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.1.2310.006192
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.177.420.001789
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.36.160.002849
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.36.260.005714
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.4090.001563
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22C.160.002121
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22Q.40.00091
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt22Q.80.00033
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AU.20.002421
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AW.10.003049
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.170.008197
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.480.000465
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.510.000909
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.530.000288
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.570.000656
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.600.000938
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.680.000274
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.70.000196
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.710.000475
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.480.002874
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.140.017544
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.160.330.004425
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.230.006061
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.258.120.007874
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.3210.034483
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.3460.001311
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.36.20.010753
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.4800.002488
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5490.007194
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11B.1.80.001972
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11C.140.004329
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11C.360.000911
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11C.36.3.10.002717
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11C.40.01
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11C.80.004464
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp5A-B129A129VgCtgTt11Q.20.000613