CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : CodonNum = 272 & Codon = ctT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B272L272LL3535LsynctGctT42562375870.88311210868-10870

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3758742562All0.007189
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1444114494AY.40.022476
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45524553AY.140.400634
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45014501B.1.177.40.949979
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT28172936B.1.1.70.002522
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT10141360B.1.617.20.003818
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11881244B.1.3510.035315
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT10191188AY.430.004515
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT741906B.10.006787
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT285888B.1.20.00251
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT681681B.1.177.90.906791
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT443461B.1.1770.005833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT386386B.1.177.300.969849
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT330381AY.250.001985
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT249266AY.1030.001546
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT234256B.1.10.004245
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT252252B.1.4270.012725
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT219220B.1.1.5190.008697
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT204204P.70.89083
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT184196P.10.002899
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT188188AY.510.170909
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT151173AY.440.000919
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT153166AY.1020.004057
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT166166AY.260.004699
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT152153B.1.177.210.011623
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3144B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT109134AY.390.002694
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT95109AY.420.003822
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT97103B.1.2430.00675
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT8796AY.1200.003235
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT7981B.1.5250.00894
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT6277AY.30.000617
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT7374AY.4.20.001583
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4673AY.200.001788
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4669B.1.4290.001082
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5962AY.540.005625
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3657B.1.2210.002557
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5355AY.46.40.008719
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5154AY.230.003557
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT5454AY.650.028785
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4749B.1.1600.001466
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4648AY.980.003634
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4548B.1.360.006566
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4444AY.46.60.003177
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4043AY.50.000826
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3741B.1.6210.003275
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2840AY.1000.001288
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4040B.1.240.11
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT4040B.1.258.220.106667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3739AY.3.10.003155
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3438AY.1180.00213
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3538AY.1190.001236
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3237B.1.5260.000752
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT3435AY.330.00227
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2934C.370.003366
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2831AY.610.002934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT830AY.370.002528
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1430B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2929AY.1040.05754
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2929B.1.1.10.009474
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1028AY.99.20.000922
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2727AY.7.10.003043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2627AY.98.10.001259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626AY.60.001069
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626AY.640.015476
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2626B.1.1.1570.023744
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2325AY.290.000363
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT2224B.1.1.2220.004488
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1920A0.007353
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1820AY.380.008987
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1620AY.460.001665
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1220AY.470.000373
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1618AY.750.000896
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1518AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1818B.1.3400.077253
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1617AD.20.003503
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1717B.1.1.280.005291
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1717B.1.1.2970.038031
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1517B.1.617.10.001934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1616AE.40.695652
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1016AY.90.000676
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1316P.1.140.000621
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515AY.1090.011095
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515AY.7.20.008389
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515B.1.351.20.004539
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1515B.1.466.20.005869
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT915B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414AY.1210.001894
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414B.1.1.3040.039326
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1214B.1.177.810.002272
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT214B.1.4530.006472
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1414B.1.5910.148936
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1313B.1.1.2160.011576
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1313Q.80.002144
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1012AY.1170.000845
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212AY.160.004556
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT812AY.16.10.003759
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT312AY.350.000699
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212AY.630.004642
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT812AY.920.002298
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212B.1.1.4340.004183
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1212C.36.30.006807
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1112Q.30.001595
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111AY.130.001771
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111AY.340.001067
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1011AY.450.001217
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1011AY.9.10.000837
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111B.1.5240.015471
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1111B.1.5670.036667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010AY.1130.001424
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT910AY.39.10.000357
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010AZ.10.008673
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.1.5120.285714
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.177.570.00281
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT910B.1.3110.002471
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT810B.1.36.80.008
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT1010B.1.5600.046296
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.270.000582
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99AY.75.10.001623
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT29AY.840.000875
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.177.790.021077
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.2400.00194
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT99B.1.2410.007305
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT69P.20.00112
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT78AY.4.2.10.001043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT78AY.620.00305
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88AY.990.008395
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.1.170.133333
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.160.300.02381
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT68B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT88B.1.36.160.011396
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT38D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77A.23.10.00493
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77AZ.20.005747
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT67B.1.1.3060.00263
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT77B.1.1.500.004752
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT46AY.1080.00441
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT56AY.320.002662
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66AY.520.004886
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.2430.02449
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.4280.056604
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.1.700.002046
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.36.240.037037
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.5230.014706
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT26B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.100.00265
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT15AY.1100.000113
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT35AY.1160.00086
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.240.002155
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45AY.46.20.002541
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT45AY.530.00115
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT25AY.560.00321
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55AY.810.00996
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.1.3480.003981
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.1.3720.003444
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT35B.1.1.390.001529
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.177.100.00439
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55B.1.2030.3125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT15B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55N.50.008834
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55P.1.170.000809
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT55R.10.00045
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.116.10.001246
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.4.40.001637
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44AY.700.000834
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT14AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34AY.930.000819
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B0.000511
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.1530.004381
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34B.1.1.2940.003797
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT34B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.330.001684
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.3730.095238
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.1.4090.011331
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.177.350.002764
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.177.860.000734
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.3690.001141
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.5750.001214
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44B.1.80.00789
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44C.350.003096
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44P.1.10.001271
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT44P.1.70.001277
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT130.055556
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.300.001187
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.360.000148
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.500.002398
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT23AY.680.000547
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33AY.830.005172
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT13AY.950.000761
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.100.003344
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.1.630.001157
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.120.024
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.160.160.002788
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.160.280.008772
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.560.002003
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT23B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.2600.010033
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.351.30.002629
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.36.180.001261
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.621.10.001517
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33C.360.002732
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT33P.1.17.10.002625
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12AY.120.000316
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.490.00639
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.70.000392
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.730.001331
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.790.002421
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.800.002257
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12AY.850.000427
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22AY.970.003401
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.1890.003026
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.2030.033898
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3070.005063
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3150.016949
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3260.003521
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3270.2
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.3760.011905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1.5230.003125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.160.150.009901
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.1620.01005
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.221.30.001667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3440.016393
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.36.10.002281
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT12B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4080.00738
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.415.10.015152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4650.007605
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.5970.009259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22B.1.930.001867
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.160.002121
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.250.25
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22C.36.3.10.005435
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22L.30.007092
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22N.90.011905
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.10.000282
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11A.30.002096
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.180.010101
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.210.001898
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.400.000964
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.600.000938
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.660.00107
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1490.016393
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1590.004673
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1850.076923
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.1940.00495
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2130.021739
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2250.007194
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.260.005236
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3320.03125
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3550.015385
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.3990.090909
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4300.041667
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4420.018519
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.4800.025
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1.890.006061
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1180.006711
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.140.017544
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1730.026316
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.1920.009259
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2010.005682
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.350.008475
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.36.390.002217
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4500.011364
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5520.015152
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5570.05
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5700.002941
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.596.10.009346
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.840.020833
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.1.910.002075
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.30.000831
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.400.000364
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11C.230.005814
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11N.60.007092
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp5A-B272L272LctGctT11P.30.001595

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.