CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : CodonNum = 245

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B245D245DD3508DsyngaCgaT81188118110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245ND3508NnonsynGacAac151151110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245YD3508YnonsynGacTac101990.98019810787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245YD3508YnonsynGaCTaT10120.01980210787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245delD3508deldelGAC---5555110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245GD3508GnonsyngAcgGc1919110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245ED3508EnonsyngaCgaA1390.69230810787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245ED3508EnonsyngaCgaG1340.30769210787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245VD3508VnonsyngAcgTc11100.90909110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245VD3508VnonsyngACgTT1110.090909110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245AD3508AnonsyngAcgCc99110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245HD3508HnonsynGacCac66110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245SD3508SnonsynGAcAGc33110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245del1D3508del1delgaCga-33110787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245FD3508FnonsynGAcTTc320.66666710787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245FD3508FnonsynGACTTT310.33333310787-10789
ORF1ab/nsp5A-B245D245del2D3508del2delgACg--11110787-10789

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT81188118All0.001553
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT19881988B.1.1.70.00178
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT18091809AY.40.002816
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT977977B.1.3750.80082
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT327327B.1.20.002879
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT211211AE.80.103178
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac151151All0.000029
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT146146B.1.160.110.834286
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT146146B.1.617.20.00055
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT142142B.1.1.2690.192152
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT113113AY.950.085997
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT111111B.1.5260.002609
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT104104B.10.000953
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT103103AY.1030.00064
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac99101All0.000019
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGaCTaT2101All0
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT9292B.520.929293
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT9090B.1.1.3010.106132
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT8787B.1.10.001578
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT8484AY.260.002378
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT8383AY.430.000368
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT6969AY.290.001088
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT6565B.1.1.5190.002581
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT5656B.1.360.00817
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---5555All0.000011
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT5454AY.440.000329
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT5353AY.30.000527
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT4949B.1.4290.001153
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT4848B.1.1.2840.005155
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT4848P.10.000756
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT4242AY.250.000253
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT4141B.1.1770.00054
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac3939AY.40.000061
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac3636AY.40.000056
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT3535B.1.3260.265152
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT3232B.1.1.2940.040506
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2828AY.1020.000742
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2828B.1.1.3330.03014
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2525AY.1000.00115
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2424B.1.1600.000749
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2222Q.80.003628
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2020AY.390.000494
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT2020AY.60.000823
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc1919All0.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1919AY.1210.002571
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1818AY.5.30.006073
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1616AY.1180.001002
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac1616AY.4.50.00172
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac1616AY.4.50.00172
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1616B.1.177.560.010681
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1616C.350.012384
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1616Q.30.002321
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac1414AY.1030.000087
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1414AY.450.001704
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1414B.1.177.810.002651
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1414B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA913All0.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaG413All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1313B.1.1280.008259
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac1313B.1.20.000114
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1212B.1.4260.012109
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc1011All0.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgACgTT111All0
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1111AY.200.000428
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010AE.10.113636
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010AY.23.10.004174
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010AY.590.005297
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010B.1.1.250.005685
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010B.1.1.630.003858
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010B.1.3510.000297
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT1010B.1.5960.000871
ORF1ab/nsp5A-B245D245AgAcgCc99All0.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac99AY.440.000055
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT99AY.990.009444
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc88AY.40.000012
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88AY.4.20.000174
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88AY.470.000249
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88AY.99.20.000737
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88B0.001022
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88B.1.1.3220.070175
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88B.1.258.210.062016
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88B.1.36.290.004139
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88B.1.4270.000404
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT88P.20.001493
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT77AY.1200.00026
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT77B.1.1.280.002179
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac77B.1.1600.000218
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66A.2.50.002994
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac66All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66AY.230.000418
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.1.1700.007481
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.1.4280.056604
ORF1ab/nsp5A-B245D245AgAcgCc66B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.177.410.015
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.5700.017647
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.5770.004124
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT66B.1.617.10.000774
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac55AY.250.00003
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55AY.740.000578
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55AY.750.00028
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac55AY.90.000338
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac55AY.90.000338
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55B.1.1.3060.002192
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55C.230.02907
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT55P.1.140.000239
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---440.222222
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44A.10.001127
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.10.001583
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.120.10.001284
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.270.000259
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.330.000267
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.360.000593
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaG44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac44AY.80.002424
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac44AY.80.002424
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.1.3170.001647
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.177.70.000659
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.177.730.002265
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.177.870.002911
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44B.1.3670.00317
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44C.380.032258
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44Q.10.000505
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT44R.10.00036
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33A.2.5.20.004717
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33A.210.00831
ORF1ab/nsp5A-B245D245del1gaCga-33All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245SGAcAGc33All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245FGAcTTc23All0
ORF1ab/nsp5A-B245D245FGACTTT13All0
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33AY.350.000699
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac33AY.430.000013
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33AY.850.001282
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac33B.10.000027
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.1.2910.002227
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.1.3910.025641
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac33B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp5A-B245D245FGAcTTc23B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc23B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac23B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgACgTT13B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGaCTaT13B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245FGACTTT13B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.177.400.015464
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.177.460.002755
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac33B.1.177.810.000568
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.36.180.001261
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.5650.002431
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.5870.005693
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33C.260.022059
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac33D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT33D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B245D245SGAcAGc220.111111
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22A0.000774
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac22A.20.001324
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22A.23.10.001408
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.120.20.002571
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---22AY.360.000296
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.400.001929
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.410.000588
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.420.00008
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGaCTaT12AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac12AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac22AY.50.000041
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.510.001818
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.540.000191
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.610.00021
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.730.001331
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac22AY.750.000112
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.790.002421
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA22B.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1.1980.002937
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac22B.1.1.270.011299
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1.4110.029412
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.1460.008475
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.177.150.001262
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.3460.002621
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc22B.1.6320.013423
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22B.1.6380.105263
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT22S.10.009901
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11A.270.001656
ORF1ab/nsp5A-B245D245del2gACg--11All0
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AP.10.001502
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AS.20.015625
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AT.10.005128
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.140.000088
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.170.008197
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.20.000356
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.30.00001
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.340.000097
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11AY.350.000233
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA11AY.40.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac11AY.40.000002
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11AY.430.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245del2gACg--11AY.430.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245del1gaCga-11AY.430.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245del1gaCga-11AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc11AY.450.000122
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.50.000021
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.580.000907
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.580.000907
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.60.000041
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.60.000041
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.600.000938
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.680.000274
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.770.001127
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac11AY.800.001129
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11AY.810.001992
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.830.001724
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.900.000684
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B245D245AgAcgCc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B245D245AgAcgCc11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.4260.035714
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.4580.041667
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.530.013699
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.1.620.027027
ORF1ab/nsp5A-B245D245del1gaCga-11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11B.1.1180.006711
ORF1ab/nsp5A-B245D245HGacCac11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.160.150.00495
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp5A-B245D245VgAcgTc11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.1.1950.005025
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp5A-B245D245AgAcgCc11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp5A-B245D245EgaCgaA11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.3500.002933
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.3700.008
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.3820.008929
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4330.003195
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4520.013699
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.466.10.007194
ORF1ab/nsp5A-B245D245YGacTac11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245GgAcgGc11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245SGAcAGc11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp5A-B245D245NGacAac11B.290.003509
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.40.002208
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11B.400.000364
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11C.160.00106
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11C.30.007634
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11C.370.000116
ORF1ab/nsp5A-B245D245delGAC---11N.40.004255
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp5A-B245D245DgaCgaT11Q.40.000455