CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | G3278S | nonsyn | Ggt | Agt | 26017 | 26016 | 0.999962 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | G3278S | nonsyn | GgT | AgC | 26017 | 1 | 0.0000384364 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | G3278C | nonsyn | Ggt | Tgt | 1363 | 1363 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | G3278D | nonsyn | gGt | gAt | 262 | 262 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | G3278G | syn | ggT | ggC | 216 | 202 | 0.935185 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | G3278G | syn | ggT | ggG | 216 | 9 | 0.0416667 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | G3278G | syn | ggT | ggA | 216 | 5 | 0.0231481 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | G3278V | nonsyn | gGt | gTt | 89 | 88 | 0.988764 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | G3278V | nonsyn | gGT | gTC | 89 | 1 | 0.011236 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | G3278del | del | GGT | --- | 54 | 54 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | G3278I | nonsyn | GGt | ATt | 6 | 5 | 0.833333 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | G3278I | nonsyn | GGT | ATC | 6 | 1 | 0.166667 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15F | G3278F | nonsyn | GGt | TTt | 4 | 4 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | G3278del2 | del | GGt | --t | 4 | 4 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | G3278R | nonsyn | Ggt | Cgt | 4 | 3 | 0.75 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | G3278R | nonsyn | GgT | CgG | 4 | 1 | 0.25 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15A | G3278A | nonsyn | gGt | gCt | 3 | 3 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | G3278del1 | del | ggT | gg- | 3 | 2 | 0.666667 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | G3278del1 | del | GgT | Ag- | 3 | 1 | 0.333333 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | G3278E | nonsyn | gGT | gAG | 2 | 1 | 0.5 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | G3278X | nonsyn | GgT | TgA | 2 | 1 | 0.5 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | G3278X | nonsyn | GGT | TAA | 2 | 1 | 0.5 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | G3278E | nonsyn | gGT | gAA | 2 | 1 | 0.5 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Y | G3278Y | nonsyn | GGt | TAt | 1 | 1 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Q | G3278Q | nonsyn | GGT | CAG | 1 | 1 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15P | G3278P | nonsyn | GGt | CCt | 1 | 1 | 1 | 10097-10099 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15H | G3278H | nonsyn | GGt | CAt | 1 | 1 | 1 | 10097-10099 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 26016 | 26017 | All | 0.004976 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | GgT | AgC | 1 | 26017 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 8464 | 8464 | C.37 | 0.982358 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2969 | 2969 | B.1.1.1 | 0.969944 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2230 | 2230 | B.1.1.369 | 0.995091 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1709 | 1709 | C.36.3 | 0.96937 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1372 | 1372 | B.1.1.372 | 0.944904 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1363 | 1363 | All | 0.000261 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1206 | 1206 | C.35 | 0.933437 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1195 | 1195 | B.1.221.3 | 0.995833 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1017 | 1017 | C.36 | 0.92623 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 914 | 914 | C.16 | 0.969247 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 578 | 578 | C.30 | 0.998273 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 449 | 449 | AY.4 | 0.000699 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 399 | 399 | C.1 | 0.954545 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 380 | 380 | C.18 | 0.984456 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 357 | 357 | C.36.3.1 | 0.970109 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 347 | 347 | C.37.1 | 0.908377 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 262 | 262 | All | 0.00005 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 240 | 240 | C.36.1 | 0.995851 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 231 | 231 | C.14 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 224 | 224 | C.8 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 222 | 222 | C.1.2 | 0.944681 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 202 | 216 | All | 0.000039 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 9 | 216 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggA | 5 | 216 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 170 | 170 | C.23 | 0.988372 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 161 | 161 | B.1 | 0.001475 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 150 | 150 | C.2.1 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 149 | 149 | C.30.1 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 139 | 139 | C.12 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 136 | 136 | C.26 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 131 | 131 | C.3 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 116 | 116 | C.38 | 0.935484 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 100 | 100 | AY.4 | 0.000156 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 98 | 98 | C.4 | 0.98 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 94 | 94 | C.11 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 88 | 89 | All | 0.000017 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGT | gTC | 1 | 89 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 89 | 89 | B.1.1 | 0.001615 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 76 | 76 | B.1.258 | 0.005058 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 67 | 67 | B.1.1.375 | 0.797619 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 62 | 62 | C.2 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 59 | 59 | B.1.1.205 | 0.219331 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 56 | 56 | C.31 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 54 | 54 | All | 0.00001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 54 | 54 | C.27 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 51 | 51 | AY.102 | 0.001352 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 49 | 49 | C.39 | 0.924528 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 48 | 48 | AY.3 | 0.000477 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 48 | 48 | B.1.617.2 | 0.000181 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 43 | 43 | C.32 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 42 | 42 | P.2 | 0.007839 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 39 | 39 | C.13 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 37 | 37 | C.19 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 36 | 36 | AY.42 | 0.001448 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 36 | 36 | C.40 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 35 | 35 | B.1.351 | 0.00104 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 33 | 33 | B.1.1.7 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 32 | 32 | C.9 | 0.969697 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 30 | 30 | AY.3 | 0.000298 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 29 | 29 | C.7 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 28 | 28 | C.36.2 | 0.965517 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 27 | 27 | C.34 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 26 | 26 | AY.4 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 26 | 26 | C.6 | 0.962963 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 25 | 25 | B.1.617.2 | 0.000094 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 25 | 25 | C.28 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 24 | 24 | B.1.258 | 0.001597 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 23 | 23 | B | 0.00294 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 23 | 23 | B.1.1.7 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 23 | 23 | B.1.1.7 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 22 | 22 | B.1.2 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 20 | 20 | B.1.214.2 | 0.01199 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 17 | 17 | C.33 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 16 | 16 | B.1.177.4 | 0.003377 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 16 | 16 | B.1.177.40 | 0.082474 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 14 | 14 | C.17 | 0.777778 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 14 | 14 | C.22 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 14 | 14 | C.29 | 0.875 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 13 | 13 | AY.103 | 0.000081 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 13 | 13 | C.20 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 12 | 12 | AY.103 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 12 | 12 | AY.9.2 | 0.000441 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 12 | 12 | B.1.2 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 12 | 12 | C.1.1 | 0.923077 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 12 | 12 | D.2 | 0.0009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 11 | 11 | AY.47 | 0.000342 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 11 | 11 | C.5 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 9 | 9 | AY.103 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 9 | 9 | AY.25 | 0.000054 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 9 | 9 | AY.25 | 0.000054 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 8 | 8 | AY.100 | 0.000368 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 8 | 8 | AY.84 | 0.0035 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 8 | 8 | C.25 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.20 | 0.000272 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | AY.43 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 7 | 7 | AY.43 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1 | 0.000064 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 7 | 7 | B.1.160.30 | 0.020833 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 7 | 7 | B.1.177.23 | 0.022654 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 7 | 7 | B.1.23 | 0.042424 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 7 | 7 | B.1.609 | 0.003356 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 7 | 7 | C.21 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGt | ATt | 5 | 6 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGT | ATC | 1 | 6 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 6 | 6 | AY.23 | 0.000418 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 6 | 6 | AY.33 | 0.000401 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | AY.39 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 6 | 6 | AY.39 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 6 | 6 | AY.44 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 6 | 6 | B.1.1.63 | 0.002315 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 6 | 6 | B.1.517 | 0.002562 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 6 | 6 | B.1.617.2 | 0.000023 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 5 | 5 | AY.100 | 0.00023 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 4 | 5 | AY.4 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 1 | 5 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 5 | 5 | B | 0.000639 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 3 | 5 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 5 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggA | 1 | 5 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.1.294 | 0.006329 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.1.348 | 0.003981 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.160 | 0.000156 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.524 | 0.007032 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 5 | 5 | D.2 | 0.000375 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggA | 2 | 4 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 4 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 1 | 4 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | GGt | --t | 4 | 4 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15F | GGt | TTt | 4 | 4 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | Ggt | Cgt | 3 | 4 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | GgT | CgG | 1 | 4 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.4.5 | 0.00043 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.1.220 | 0.007435 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 4 | 4 | B.1.1.448 | 0.00813 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 4 | 4 | B.1.177 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 4 | 4 | C.10 | 1 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15F | GGt | TTt | 4 | 4 | D.2 | 0.0003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 3 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | GgT | AgC | 1 | 3 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15A | gGt | gCt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | ggT | gg- | 2 | 3 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | GgT | Ag- | 1 | 3 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.18 | 0.030303 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.26 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.3 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 3 | 3 | AY.39 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | AY.4 | 0.000005 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 3 | 3 | AY.92 | 0.000862 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.1.409 | 0.008499 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.1.506 | 0.111111 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 3 | 3 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.221 | 0.000213 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 2 | 3 | B.1.221 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggA | 1 | 3 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.351.2 | 0.000908 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1.526 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGt | ATt | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGT | gTC | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | GGT | TAA | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGT | ATC | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | GgT | TgA | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | A | 0.000774 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | GGT | TAA | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15X | GgT | TgA | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | gGT | gAG | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | gGT | gAA | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.102 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.102 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGt | ATt | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.23 | 0.000139 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.3 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.39.1 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.42 | 0.00008 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 2 | 2 | AY.46 | 0.000208 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.47 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.62 | 0.000871 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.67 | 0.000929 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 2 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 1 | 2 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.1.306 | 0.000877 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.1.526 | 0.007092 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.1.83 | 0.00542 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.160 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.170 | 0.008621 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.177.75 | 0.002081 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | GgT | CgG | 1 | 2 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | Ggt | Cgt | 1 | 2 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.240 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | B.1.351 | 0.000059 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.371 | 0.002245 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.617.2 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.621 | 0.000177 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.81 | 0.042553 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 2 | 2 | P.1.15 | 0.000465 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 2 | 2 | R.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Y | GGt | TAt | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | gGT | gAA | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | A.2 | 0.000662 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AH.2 | 0.012048 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AK.1 | 0.012658 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Y | GGt | TAt | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15P | GGt | CCt | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Q | GGT | CAG | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15H | GGt | CAt | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.118 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | GgT | Ag- | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.121 | 0.000135 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.14 | 0.000088 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.16 | 0.00038 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15A | gGt | gCt | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggA | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del2 | GGt | --t | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.62 | 0.000436 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.78 | 0.001541 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.96 | 0.002075 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.99.2 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.129 | 0.009174 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.159 | 0.004673 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.161 | 0.003534 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.164 | 0.005155 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.194 | 0.00495 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.284 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.304 | 0.002809 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.324 | 0.052632 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.379 | 0.03125 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.385 | 0.004464 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.402 | 0.011111 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.416 | 0.000905 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.485 | 0.016667 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.52 | 0.012195 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.140 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.161 | 0.017241 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.162 | 0.005025 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.10 | 0.000878 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.18 | 0.00116 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.4 | 0.000211 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.69 | 0.001484 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.84 | 0.006667 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.84 | 0.006667 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.179 | 0.003759 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.210 | 0.002132 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.214.3 | 0.007143 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15H | GGt | CAt | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15Q | GGT | CAG | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15E | gGT | gAG | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.221.3 | 0.000833 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.234 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.258.3 | 0.001675 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.351.3 | 0.000876 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.36.10 | 0.004785 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.398 | 0.002976 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.399 | 0.001934 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.416 | 0.001269 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.465 | 0.003802 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.466 | 0.023256 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.527 | 0.003704 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.544 | 0.006024 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.554 | 0.004405 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.561 | 0.000397 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.609 | 0.000479 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15P | GGt | CCt | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.9.4 | 0.006135 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGt | ATt | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15I | GGt | ATt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15A | gGt | gCt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | N.4 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | N.4 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | N.6 | 0.007092 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15G | ggT | ggC | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.2 | 0.001156 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.4 | 0.000977 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | P.6 | 0.003145 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15del | GGT | --- | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15V | gGt | gTt | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15D | gGt | gAt | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp5A-B | 15 | G15S | Ggt | Agt | 1 | 1 | Q.7 | 0.001111 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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