CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp5A-B : CodonNum = 114

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp5A-B114V114VV3377VsyngtGgtT20773205280.98820610394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114VV3377VsyngtGgtA207731380.0066432410394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114VV3377VsyngtGgtC207731070.0051509210394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114LV3377LnonsynGtgTtg1881850.98404310394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114LV3377LnonsynGtgCtg18830.015957410394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114MV3377MnonsynGtgAtg5959110394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114AV3377AnonsyngTggCg51500.98039210394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114AV3377AnonsyngTGgCA5110.019607810394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114delV3377deldelGTG---2121110394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114del2V3377del2delGTg--g11110394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114GV3377GnonsyngTGgGT11110394-10396
ORF1ab/nsp5A-B114V114EV3377EnonsyngTggAg11110394-10396

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2052820773All0.003926
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA13820773All0.000026
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC10720773All0.00002
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT67786778Q.30.983031
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33053305B.1.351.21
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT17221722AY.940.762284
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT16641678AY.40.00259
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA141678AY.40.000022
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11411141B.1.351.31
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT822825AY.440.005003
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA2825AY.440.000012
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC1825AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT655694B.1.1.70.000586
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA22694B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC17694B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT611632B.1.617.20.002301
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA15632B.1.617.20.000056
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC6632B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT465476AY.430.00206
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC8476AY.430.000035
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA3476AY.430.000013
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT286286B.1.36.10.326112
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT273278B.1.20.002404
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA5278B.1.20.000044
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT228228B.1.1.5190.009054
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg185188All0.000035
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgCtg3188All0.000001
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT174183P.10.002741
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA9183P.10.000142
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT129130AY.250.000776
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA1130AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT120122B.10.001099
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA1122B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC1122B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT112117AY.1030.000695
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA4117AY.1030.000025
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC1117AY.1030.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT112112AY.1060.037508
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT105105B.1.3510.003121
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT86102AY.30.000855
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA9102AY.30.00009
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC7102AY.30.00007
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT6377AY.1020.00167
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA1477AY.1020.000371
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT7777AY.1210.010419
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT7072B.1.10.00127
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC272B.1.10.000036
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg6262AY.430.000275
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT6060B.1.4290.001412
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg5959All0.000011
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT5757AY.1190.002013
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg5051All0.00001
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTGgCA151All0
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT5051B.1.1770.000658
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC151B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT4149AY.470.001275
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC849AY.470.000249
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT4949B.1.1.700.016712
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT4546AY.390.001112
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA146AY.390.000025
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2441B.1.1.2220.004896
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC1741B.1.1.2220.003468
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT4040AY.330.002671
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT3939B.1.466.20.015258
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg3434AY.390.00084
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2929AY.46.60.002094
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2628AY.50.000537
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA228AY.50.000041
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2727B.1.5950.007046
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2727C.350.020898
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2626AY.450.003164
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2526B.1.2430.00174
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC126B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2525B.1.6210.002213
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2024AY.1000.00092
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC424AY.1000.000184
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2323AY.1170.001944
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg2323AY.130.003703
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg2323B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1222AY.4.50.00129
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC1022AY.4.50.001075
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2222B.1.4000.009438
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---2121All0.000004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2121B.1.160.70.043659
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT2121P.1.100.005659
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1819AY.420.000724
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA119AY.420.00004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1819AY.98.10.000872
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA119AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1818B.1.5650.014587
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1717AY.1200.000632
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1717AY.90.001149
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1617B.1.4040.020833
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA117B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1516AY.200.000583
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC116AY.200.000039
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1616B.1.1.3680.049383
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1616B.1.2980.033827
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1616B.1.617.10.002063
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1515AY.9.20.000551
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1515B.1.1.390.007645
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1515B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1414AY.1140.003235
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1214B.1.5960.001046
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA214B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1313AY.230.000907
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1212AY.100.006359
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1212B.1.2580.000799
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1112B.1.4270.000555
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC112B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1011AY.4.20.000217
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA111AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1111AY.460.001145
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1010AY.840.004374
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1010AY.99.20.000922
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA910B.1.3620.013867
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT110B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT1010P.1.120.00484
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT99A.2.50.004491
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT99AY.290.000142
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT99AY.900.00616
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT89B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC19B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT99B.1.5750.002731
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT78AY.260.000198
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA18AY.260.000028
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg88AY.330.000534
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg88AY.98.10.000387
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT88B.1.1.1700.009975
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT88B.1.1.2310.024768
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT78C.370.000812
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC18C.370.000116
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT77AY.1130.000997
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT77AY.60.000288
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT77AY.610.000733
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT47AY.980.000316
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA37AY.980.000237
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT77B.1.1600.000218
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT66B.1.36.290.003104
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT66B.1.5620.111111
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT66B.1.6300.031414
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT66P.1.140.000287
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT56P.20.000933
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA16P.20.000187
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT45AY.1050.002572
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC15AY.1050.000643
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55AY.120.2.10.002491
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55AY.340.000485
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg55AY.40.000008
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55AY.46.10.005133
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55AY.920.001436
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT45B.1.1.10.001307
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA15B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55B.1.1.2690.006766
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA55B.1.1.4160.004525
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT55B.1.3160.555556
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT45B.1.5760.003626
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC15B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT35Q.80.000495
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC15Q.80.000165
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA15Q.80.000165
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---440.222222
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg44AY.250.000024
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44AY.5.20.009852
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44AY.510.003636
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC44AY.690.000747
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44AY.740.000463
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT34AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA14AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg44AY.80.002424
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg44B.10.000037
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44B.1.4430.018692
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44B.1.4990.004202
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44B.400.001457
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT34D.20.000225
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA14D.20.000075
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44N.60.028369
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT34P.1.150.000697
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA14P.1.150.000232
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT44P.1.170.000647
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC44P.1.17.10.0035
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33A.2.40.010101
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.320.001597
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.370.000948
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.4.10.002212
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg33AY.440.000018
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.580.002722
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.7.10.000338
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg33AY.750.000168
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.830.005172
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.860.00249
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.1.2320.005445
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.1430.06383
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.160.330.013274
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.177.520.005272
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.177.560.002003
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.4160.003807
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.4510.02459
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.5540.013216
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.5880.00273
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC33R.10.00027
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA12AY.160.00038
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT12AY.160.00038
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT12AY.270.000065
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC12AY.270.000065
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg22AY.40.000003
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg22AY.470.000062
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AY.70.000392
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AY.850.000854
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AY.930.000546
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22AZ.30.00304
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B0.000256
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.1.3290.007692
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.1.500.001358
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.1.5250.010929
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC12B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT12B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg22B.1.1470.001512
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.177.200.003035
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.214.20.001199
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.3190.006098
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.5380.016129
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.5640.000852
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.5740.004301
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg12B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTGgCA12B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.6180.008065
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.6200.001892
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22N.40.008511
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22N.50.003534
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22Q.40.00091
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg22Q.70.002222
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT22U.20.017544
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg110.055556
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11A.10.000282
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11A.20.000662
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11A.20.000662
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11A.2.5.10.004808
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11A.210.00277
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp5A-B114V114EgTggAg11All0
ORF1ab/nsp5A-B114V114GgTGgGT11All0
ORF1ab/nsp5A-B114V114del2GTg--g11All0
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AU.30.00211
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgCtg11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11AY.360.000148
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.450.000122
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.470.000031
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.60.000041
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.660.00107
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.730.000665
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.770.001127
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.800.001129
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgCtg11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B0.000128
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114EgTggAg11B.10.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgCtg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.2680.014925
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3660.015873
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.4820.023256
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.5160.066667
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.520.012195
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1.5240.020833
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtC11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.450.000381
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.480.003125
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.720.00339
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp5A-B114V114GgTGgGT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp5A-B114V114del2GTg--g11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtA11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.36.260.002857
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.3850.010638
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.4500.011364
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.4870.019608
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.5000.052632
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp5A-B114V114MGtgAtg11B.610.005747
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11C.180.002591
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11C.360.000911
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg11D.20.000075
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp5A-B114V114delGTG---11N.40.004255
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11N.90.005952
ORF1ab/nsp5A-B114V114AgTggCg11P.10.000016
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11P.1.90.004808
ORF1ab/nsp5A-B114V114VgtGgtT11P.70.004367
ORF1ab/nsp5A-B114V114LGtgTtg11Q.80.000165