CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = W6C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp46W6CW2769CnonsyntgGtgT473047200.9978868570-8572
ORF1ab/nsp46W6CW2769CnonsyntgGtgC4730100.002114168570-8572

Details of the mutation W6C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT47204730All0.000903
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC104730All0.000002
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT40234024B.1.1.70.003601
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC14024B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT154154B.1.1.3890.933333
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT144144AY.440.000876
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT5859AY.40.00009
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC159AY.40.000002
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT5959B.1.1.1590.275701
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT3838AY.7.20.021253
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT2121AY.430.000093
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT1717AY.690.003173
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT1313AY.30.000129
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT1111B.1.3620.016949
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT99B.1.351.20.002723
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT88B.1.1.1890.012103
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT88B.1.177.240.010363
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT77B.10.000064
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT77P.10.00011
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT77Q.80.001154
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT45AY.1020.000106
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC15AY.1020.000027
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT55AY.1170.000423
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT55B.1.1.500.003394
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT44AY.390.000099
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33AY.420.000121
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33AY.860.00249
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33B0.000383
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33B.1.1.2770.002276
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.230.000139
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.250.000012
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.610.00021
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22AY.980.000158
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT22P.50.027397
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AM.40.003571
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.50.000021
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgC11AY.540.000095
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.840.000437
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.1870.00885
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.2410.00207
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11C.360.000911
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11L.30.003546
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11P.1.80.004785
ORF1ab/nsp46W6CtgGtgT11Q.10.000126