CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = V344A

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4344V344AV3107AnonsyngTtgCt16316319584-9586

Details of the mutation V344A within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt163163All0.000031
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt6363B.1.1.5190.002502
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt1717B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt1616AY.1030.000099
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt88AY.1050.005145
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt66AY.230.000418
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt55AY.40.000008
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt44AY.290.000063
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt44AY.470.000124
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt22AY.700.000417
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt22B.1.6190.001742
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt22P.10.000032
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.350.000233
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11AY.930.000273
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.10.000009
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11B.6.80.008264
ORF1ab/nsp4344V344AgTtgCt11P.1.150.000232