CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = V180I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4180V180IV2943InonsynGttAtt5235210.9961769092-9094
ORF1ab/nsp4180V180IV2943InonsynGtTAtA52320.003824099092-9094

Details of the mutation V180I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt521523All0.0001
ORF1ab/nsp4180V180IGtTAtA2523All0
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt170170B.1.36.280.977011
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt8888AY.40.000137
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt3535B.1.617.20.000132
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt3434B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt2323B.1.10.000417
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt1313B.1.1.3480.01035
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt1212AY.440.000073
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt1111AY.430.000049
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt99AY.30.00009
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt99B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt88B.1.1.1570.007306
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt88B.1.360.001167
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt55AY.1140.001156
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt55B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt240.111111
ORF1ab/nsp4180V180IGtTAtA240.111111
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt44AY.340.000388
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt33B.10.000027
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt33B.1.1.3170.001235
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22AY.260.000057
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.360.000148
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.820.001357
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.940.000443
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.1.2280.003049
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.1.3070.002532
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.5110.034483
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11B.1.6290.013333
ORF1ab/nsp4180V180IGttAtt11P.30.001595