CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = V167L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4167V167LV2930LnonsynGtaTta241759024173580.9999049053-9055
ORF1ab/nsp4167V167LV2930LnonsynGtATtG24175901660.00006866349053-9055
ORF1ab/nsp4167V167LV2930LnonsynGtaCta2417590660.00002729999053-9055

Details of the mutation V167L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta24173582417590All0.462348
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG1662417590All0.000032
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta662417590All0.000013
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta642433642437AY.40.999897
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG4642437AY.40.000006
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta223019223060B.1.617.20.839759
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG22223060B.1.617.20.000083
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta19223060B.1.617.20.000072
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta220722220762AY.430.977901
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta34220762AY.430.000151
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG6220762AY.430.000027
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta165375165381AY.250.994701
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG5165381AY.250.00003
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta1165381AY.250.000006
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta161632161635AY.440.983815
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG2161635AY.440.000012
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta1161635AY.440.000006
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta160000160009AY.1030.993449
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG6160009AY.1030.000037
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta3160009AY.1030.000019
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta100063100068AY.30.995266
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta4100068AY.30.00004
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG1100068AY.30.00001
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta6335763377AY.290.999369
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG1963377AY.290.0003
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta163377AY.290.000016
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta4824348243AY.50.99618
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta4605446055AY.4.20.99885
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta146055AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3957239575AY.390.977883
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG339575AY.390.000074
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3767037694AY.1020.99878
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG2437694AY.1020.000636
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2818628186AY.1190.995198
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2683926840AY.1200.997844
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG126840AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2540125455AY.200.987213
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG5425455AY.200.002099
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2511225114AY.39.10.994771
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG225114AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2453324535AY.420.986965
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG124535AY.420.00004
ORF1ab/nsp4167V167LGtaCta124535AY.420.00004
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2428724287AY.60.99889
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2157521576AY.1000.992593
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG121576AY.1000.000046
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2036020360AY.98.10.986052
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1588915889AY.1180.995427
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1474214742AY.330.984441
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1396613966AY.230.974123
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1359713597AY.46.60.981804
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1234812348AY.980.975432
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1169411694AY.3.10.997016
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1153811540AY.1170.975152
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG211540AY.1170.000169
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1073610737AY.99.20.989402
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG110737AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1021810218AY.340.990788
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta93049311AY.460.96836
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG79311AY.460.000729
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta88368836AY.7.10.99583
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta85108510AY.4.50.914759
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta82508250AY.1100.929682
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta79757975AY.450.970431
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta72337233AY.1210.978755
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta68846884AY.1130.980208
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta66746674AY.4.2.10.994338
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta66606660AY.360.987105
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta60576057AY.46.40.996381
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta54495449AY.1110.997985
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta50845084AY.70.996472
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta50385038AY.46.50.999603
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta45324532AY.29.10.999338
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta42964296AY.1140.992836
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta36173617AY.930.987712
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta34943496AY.5.40.966796
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG23496AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta33273328AY.920.95576
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG13328AY.920.000287
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta32673267AY.410.960317
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta31953195AY.116.10.995017
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta31273127AY.120.988306
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta31043104AY.120.10.996469
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta29232923AY.5.30.986167
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta29062906AY.1060.973208
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta25032503AY.1160.717809
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta24982498AY.10.988524
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta24032403AY.4.40.983224
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta23962396AY.23.11
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta22712271AY.850.970098
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta22512251AY.940.996459
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta22182218AY.840.970254
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta21372137AY.1070.995806
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta20132013AY.1010.987249
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta20032003AY.120.2.10.998007
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta19591959AY.34.10.99898
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta18171817AY.320.967519
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta16651665AY.7.20.931208
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta14651465AY.1050.942122
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta14491450AY.46.20.920584
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG11450AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta13801380AY.39.1.11
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta13711371AY.900.938398
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta13531353AY.4.10.997788
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta13471347AY.910.98393
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta13281328AY.1090.982249
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta12481248AY.950.949772
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta11771177AY.870.980017
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta11601160AY.860.962656
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta11561156AY.4.30.973064
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta11011102AY.880.973475
ORF1ab/nsp4167V167LGtATtG11102AY.880.000884
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta10671067AY.46.30.996265
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta944944AY.990.990556
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta921921AY.470.028648
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta882882AY.800.995485
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta842842AY.46.10.864476
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta838838AY.770.944758
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta826826AY.750.046275
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta822822AY.790.995157
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta758758AY.1080.835722
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta725725AY.120.20.931877
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta709709AY.820.962008
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta707707AY.9.20.025968
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta663663B.10.006073
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta649649AY.39.21
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta623623AY.99.10.967391
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta613613AY.730.407851
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta583583AY.970.991497
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta577577AY.780.88906
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta575575AY.830.991379
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta497497AY.1040.986111
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta487487AY.810.97012
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta471471AY.210.893738
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta471471AY.220.985356
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta465465AY.960.96473
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta449449AY.550.411927
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta441441AY.680.120723
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta402402AY.5.20.990148
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta383383AY.740.044293
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta315315AY.540.030034
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta290290AY.590.153602
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta281281AY.190.32041
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta267267AY.580.242287
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta266266AY.5.11
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta239239AY.91.10.971545
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta234234AY.75.10.042193
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta223223AY.530.064117
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta213213B0.027224
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta203203AY.890.995098
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta201201AY.760.971014
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta200200AY.380.09985
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta181181AY.690.033788
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta172172AY.1150.895833
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta172172AY.520.140065
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta167167AY.640.099405
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta159159AY.670.073816
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta147147AY.370.04646
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta143143AY.560.229535
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta135135AY.100.071542
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta132132AY.160.050114
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta127127AY.630.04913
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta108108AY.570.070866
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta107107AY.400.103182
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta9999AY.260.002803
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta9999B.1.1.70.000089
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta9898AY.130.015776
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta9898AY.140.008625
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta9393AY.700.019391
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta8585AY.480.039535
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta8181AY.350.018877
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta7676AY.620.033115
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta7373AY.300.028888
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta6969AY.650.03678
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta6363AY.600.059099
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta6363AY.710.029929
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta5252AY.110.069612
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta4343B.1.10.00078
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3939AY.500.031175
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3636AY.490.115016
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3535B.1.5960.00305
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3131AY.240.013362
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3131AY.610.003248
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3030AY.16.10.014098
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta3030AY.170.245902
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2323AY.510.020909
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2323AY.90.001555
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta2020AY.280.037807
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1818P.10.000284
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1717AY.9.10.001423
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1717B.1.617.10.002192
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1515AY.80.009091
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1414AY.660.014973
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1313B.1.1.5260.046099
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1313B.1.20.000114
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1313B.1.6230.006974
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta1010AY.720.013605
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta88A0.003096
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta88AY.270.000518
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta88B.1.6210.000708
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta66B.1.3750.004918
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta66P.20.00112
ORF1ab/nsp4167V167LGtaTta55B.1.1770.000066
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