CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = S137del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4137S137delS2900deldelTCA---16216218963-8965

Details of the mutation S137del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---162162All0.000031
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---8080B.1.1.70.000072
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---88AY.430.000035
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AH.30.003802
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.520.000814
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.950.000761
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.1.3090.005848
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.2420.018868
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11P.10.000016
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11Q.10.000126