CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = N396del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4396N396delN3159deldelAAT---10410419740-9742

Details of the mutation N396del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---104104All0.00002
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---4646B.1.1.70.000041
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---1010B.1.1770.000132
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---77AY.40.000011
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---77AY.4.50.000752
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---44AY.430.000018
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---22AY.99.10.003106
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.580.001332
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp4396N396delAAT---11U.30.003861