CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = L185L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4185L185LL2948LsynTtaCta3572730.7647069107-9109
ORF1ab/nsp4185L185LL2948LsynttAttG357840.2352949107-9109

Details of the mutation L185L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta273357All0.000052
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG84357All0.000016
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta8890B.1.4290.002071
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG290B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta8888B.1.3350.907216
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta2125B.10.000192
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG425B.10.000037
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta1721B.1.1.70.000015
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG421B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta2020P.10.000315
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta1016AY.40.000016
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG616AY.40.000009
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG77A.2.5.20.011006
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG57AY.430.000022
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta27AY.430.000009
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG66AY.200.000233
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG46B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta26B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta35B.1.10.000054
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG25B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta44AY.260.000113
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG44AY.360.000593
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG44AY.50.000083
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG44P.60.012579
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta23AY.30.00002
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG13AY.30.00001
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta33AY.90.000203
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta12AY.470.000031
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG12AY.470.000031
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.120.000316
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.290.000016
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.670.000464
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.710.000475
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11AY.950.000761
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp4185L185LTtaCta11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4185L185LttAttG11D.20.000075