CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = F17L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp417F17LF2780LnonsynTtcCtc45068449800.9980478603-8605
ORF1ab/nsp417F17LF2780LnonsynTtCCtT45068440.0009763028603-8605
ORF1ab/nsp417F17LF2780LnonsynttCttA45068390.0008653598603-8605
ORF1ab/nsp417F17LF2780LnonsynttCttG4506840.00008875488603-8605
ORF1ab/nsp417F17LF2780LnonsynTtCCtA4506810.00002218878603-8605

Details of the mutation F17L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc4498045068All0.008603
ORF1ab/nsp417F17LTtCCtT4445068All0.000008
ORF1ab/nsp417F17LttCttA3945068All0.000007
ORF1ab/nsp417F17LttCttG445068All0.000001
ORF1ab/nsp417F17LTtCCtA145068All0
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc4425944299B.1.1.70.039622
ORF1ab/nsp417F17LTtCCtT3944299B.1.1.70.000035
ORF1ab/nsp417F17LTtCCtA144299B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc392397Q.80.064644
ORF1ab/nsp417F17LTtCCtT5397Q.80.000825
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc7883AY.440.000475
ORF1ab/nsp417F17LttCttA583AY.440.00003
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc4748B.1.10.000853
ORF1ab/nsp417F17LttCttA148B.1.10.000018
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc3843B.10.000348
ORF1ab/nsp417F17LttCttA343B.10.000027
ORF1ab/nsp417F17LttCttG243B.10.000018
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc3535AY.9.10.00293
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc2222AY.9.20.000808
ORF1ab/nsp417F17LttCttA711AY.40.000011
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc411AY.40.000006
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc711B.1.2210.000497
ORF1ab/nsp417F17LttCttA411B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc55AY.250.00003
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc35B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp417F17LttCttA25B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc55Q.10.000632
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc44B.1.1.1570.003653
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc44Q.50.067797
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc23AY.430.000009
ORF1ab/nsp417F17LttCttA13AY.430.000004
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc33B.1.177.730.001699
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc33Q.40.001364
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc33Q.60.019868
ORF1ab/nsp417F17LttCttA22AY.130.000322
ORF1ab/nsp417F17LttCttA12AY.230.00007
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc12AY.230.00007
ORF1ab/nsp417F17LttCttA12AY.390.000025
ORF1ab/nsp417F17LttCttG12AY.390.000025
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc22P.10.000032
ORF1ab/nsp417F17LttCttA110.055556
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11A.20.000662
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.30.00001
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11AY.470.000031
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.540.000095
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.600.000938
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11AY.650.000533
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11AY.980.000079
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1.1810.004545
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1.2860.002899
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.1.3490.010309
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.1.480.002874
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.177.580.001332
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.3930.028571
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp417F17LttCttA11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp417F17LttCttG11D.20.000075
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp417F17LTtcCtc11P.1.120.000484