CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = D50G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp450D50GD2813GnonsyngAtgGt676718702-8704

Details of the mutation D50G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt6767All0.000013
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt77AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt44AY.200.000155
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt44AY.40.000006
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt22B.10.000018
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt22B.1.351.30.001753
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt22P.10.000032
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.570.000656
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.730.000665
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11D.20.000075
ORF1ab/nsp450D50GgAtgGt11P.20.000187