CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = D217G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4217D217GD2980GnonsyngAtgGt10055100530.9998019203-9205
ORF1ab/nsp4217D217GD2980GnonsyngATgGC1005510.0000994539203-9205
ORF1ab/nsp4217D217GD2980GnonsyngATgGA1005510.0000994539203-9205

Details of the mutation D217G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1005310055All0.001923
ORF1ab/nsp4217D217GgATgGA110055All0
ORF1ab/nsp4217D217GgATgGC110055All0
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt68176817B.1.2340.899459
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt642642B.1.214.20.384892
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt593593A.270.981788
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt438438B.10.004012
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt325325AY.470.010109
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt263263B.1.1.70.000235
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt146146B.1.20.001286
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt118118B.1.2580.007853
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt6666B.1.2430.004593
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt5656AY.1030.000348
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt4040B.1.5960.003486
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt3434B.1.10.000617
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt3434B.1.2210.002415
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt2424B.1.1770.000316
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1919A0.007353
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1818B.1.617.20.000068
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1515B0.001917
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1414B.1.2060.011419
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1313AY.30.000129
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1212B.1.2100.025586
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1212B.1.5170.005124
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1111B.1.2140.040293
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1111B.1.4290.000259
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1111B.1.6390.23913
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt1010B.1.1.100.011148
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt99AY.40.000014
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt99AY.440.000055
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt99B.1.36.290.004656
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt99P.10.000142
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt88AY.290.000126
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt88B.1.1.10.002614
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt77AY.4.20.000152
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt77B.1.5950.001827
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt66B.1.1.500.004073
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt66B.1.2400.001293
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt66P.1.150.001394
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt55B.1.177.730.002831
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt55B.1.3490.003574
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt55B.1.4970.001574
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44AY.250.000024
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44AY.740.000463
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44B.1.1600.000125
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44B.1.3960.002823
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44B.1.5690.057971
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt44C.370.000464
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt230.111111
ORF1ab/nsp4217D217GgATgGA130.055556
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33A.290.015957
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33AY.860.00249
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.214.10.06
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.3110.000824
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.5800.012195
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt33B.520.030303
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22A.20.001324
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22AY.320.001065
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22AY.340.000194
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22AY.620.000871
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1.3980.006452
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1.4220.090909
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1110.00235
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.1790.007519
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.2840.026316
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.36.100.009569
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.362.20.009434
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.4030.006536
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.4170.057143
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.5670.006667
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.5770.001375
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.5810.018868
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22B.1.88.10.009615
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt22R.10.00018
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11A.10.000282
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AW.10.003049
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.180.010101
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.770.001127
ORF1ab/nsp4217D217GgATgGC11AY.780.001541
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.2430.004082
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.3880.045455
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.4400.011765
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.5180.006329
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1130.015625
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.160.330.004425
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.3820.008929
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.3950.007042
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.5660.019231
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11B.410.008
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11C.60.037037
ORF1ab/nsp4217D217GgAtgGt11Q.40.000455