CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = C88C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp488C88CC2851CsyntgCtgT3919391918816-8818

Details of the mutation C88C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT39193919All0.00075
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11981198B.1.1.70.001072
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT295295AE.80.144254
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT222222AY.40.000346
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT172172AY.140.015138
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT169169AY.470.005257
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT121121B.1.20.001065
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT108108B.10.000989
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT105105AY.30.001044
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT103103B.1.1340.562842
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT9898B.1.617.20.000369
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT9696AY.430.000425
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT6969B.1.1600.002152
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT6262AY.260.001755
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4949B.1.4290.001153
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4848AY.250.000289
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4747AY.440.000286
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4343B.1.10.00078
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4141B.1.1.3490.42268
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3535AY.98.10.001695
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434AY.1100.003831
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434AY.46.50.006746
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434B.1.1.290.350515
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2929B.1.3300.828571
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2828AY.1030.000174
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222AY.1180.001378
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222B.1.3510.000654
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222B.1.466.20.008607
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2020P.10.000315
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1919AY.130.003059
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818AY.750.001008
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818B.1.1.2220.003672
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818B.1.1770.000237
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1616B.1.5960.001394
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.1200.000558
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.390.000371
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212AY.1110.002198
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212B.1.360.001751
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1111B.1.6390.23913
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1010B.60.009099
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99AY.50.000186
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99AY.540.000858
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99B.1.1.4340.003137
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99B.1.5820.004416
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99P.20.00168
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.1.3060.003507
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.6320.053691
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT77AY.1210.000947
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT77AY.230.000488
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.120.10.001926
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.330.000401
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.1.3050.023166
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.2210.000426
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.258.170.000624
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55A.23.10.003521
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.1060.001674
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.300.001979
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55B.1.5610.001985
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55R.10.00045
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.570.002625
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.840.00175
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.2410.003247
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AU.20.007264
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.4860.004732
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1100.013575
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.50.003727
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.570.000843
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.5750.00091
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.510.001818
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.2690.002706
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.3880.090909
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.3460.002621
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.910.004149
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22N.50.003534
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.940.000443
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B0.000128
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.1440.028571
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.580.010204
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11C.370.000116
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11W.10.008696