CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : Mut = A307V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4307A307VA3070VnonsyngCtgTt9044904419473-9475

Details of the mutation A307V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt90449044All0.00173
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22462246AY.40.003496
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt17331733AY.1010.849926
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt600600AY.440.003652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt565565B.1.617.20.002127
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt341341AY.30.003392
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt266266AY.1030.001652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt256256B.1.20.002254
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt249249AY.250.001498
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt211211AY.430.000935
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt202202AY.390.004992
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt130130B.1.1770.001712
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt120120B.10.001099
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt115115AY.1190.00406
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt114114B.1.1.70.000102
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt109109B.1.10.001977
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt101101AY.200.003925
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt9797AY.330.006477
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt7676B.1.1600.00237
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6969AY.99.20.006359
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6161AY.1020.001617
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6161AY.4.20.001323
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5353AY.1140.012249
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5151AY.1000.002346
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5151AY.60.002098
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5050AY.750.002801
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt4949AY.290.000773
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt4242B.1.1.10.013721
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2929AY.1180.001817
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2929B.1.1.330.012205
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2626B.1.1.5190.001032
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2424B.1.2210.001705
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2323B.1.5750.006978
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2222AY.50.000454
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2222B.1.2340.002903
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2121AY.120.10.006742
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2020B.1.2430.001392
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919AY.420.000764
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919B.1.5960.001656
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919W.40.025676
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1818D.20.001351
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717AY.1060.005693
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717AY.4.50.001827
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717P.10.000268
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1515AY.1170.001268
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414AY.46.60.001011
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414B0.001789
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1313B.1.1670.101562
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212AY.230.000837
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212AY.3.10.001023
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212B.1.4290.000282
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.1200.000409
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.450.001339
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010AY.260.000283
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010B.1.4970.003148
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99B.1.1.280.002801
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99B.1.1.4340.003137
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.1.177.210.000612
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.1.360.001167
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.400.002914
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.1100.000789
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.460.000729
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.610.000733
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.980.000553
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77B.1.4860.777778
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.29.10.001323
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.340.000582
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.350.001398
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.320.008097
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.730.003398
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.770.004357
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.5610.002382
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.6230.003219
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.120.00158
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.740.000578
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.910.003652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.250.002843
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.4320.006329
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.320.00213
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.620.001743
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.850.001709
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.960.008299
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.3850.017857
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.5210.02139
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.2010.022727
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.438.10.000429
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.5770.002749
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.840.083333
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.20.001068
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.480.001395
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.540.000286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.590.001589
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.680.000821
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.840.001312
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.90.000203
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.1530.003286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.3820.107143
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.80.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.130.007126
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5880.00273
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33P.1.40.00293
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33R.10.00027
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22A0.000774
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.270.000129
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.560.00321
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.1170.019417
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.1780.083333
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.2770.001517
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.2860.005797
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.110.10.2
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.160.160.001859
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.160.90.014388
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.380.020833
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.650.001331
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2500.028986
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.258.160.003273
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2800.014286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.30.005236
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3320.006993
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3910.002255
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.4090.001563
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.5550.044444
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.100.016529
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.3.10.003317
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.40.004415
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22C.370.000232
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22P.20.000373
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22Q.10.000253
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt110.055556
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.10.000282
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.2.5.20.001572
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.30.002096
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AW.10.003049
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.410.000294
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.700.000209
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.810.001992
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1690.018182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1800.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2080.012195
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2400.004695
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2660.012195
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.410.006329
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4400.011765
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4470.035714
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4580.041667
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.550.012987
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.580.005376
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1030.019231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1080.005814
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.120.008
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1590.012195
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.220.006757
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.310.008065
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.30.007634
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.790.002342
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1820.007246
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1920.009259
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2110.025
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2200.01087
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.221.20.004016
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2510.021739
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2540.025
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.240.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3550.011111
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3780.006849
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5490.007194
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5540.004405
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.6070.052632
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.970.025641
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.110.005128
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.30.000831
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.380.02381
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.520.010101
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11C.10.002392
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11P.1.60.001946