CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 88

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp488C88CC2851CsyntgCtgT3919391918816-8818
ORF1ab/nsp488C88delC2851deldelTGC---929218816-8818
ORF1ab/nsp488C88SC2851SnonsyntGctCc26230.8846158816-8818
ORF1ab/nsp488C88SC2851SnonsynTgcAgc2620.07692318816-8818
ORF1ab/nsp488C88SC2851SnonsyntGCtCT2610.03846158816-8818
ORF1ab/nsp488C88FC2851FnonsyntGctTc161618816-8818
ORF1ab/nsp488C88YC2851YnonsyntGctAc11100.9090918816-8818
ORF1ab/nsp488C88YC2851YnonsyntGCtAT1110.09090918816-8818
ORF1ab/nsp488C88XC2851XnonsyntgCtgA980.8888898816-8818
ORF1ab/nsp488C88XC2851XnonsyntGCtAG910.1111118816-8818
ORF1ab/nsp488C88del2C2851del2deltGCt--870.8758816-8818
ORF1ab/nsp488C88del2C2851del2delTGc--c810.1258816-8818
ORF1ab/nsp488C88GC2851GnonsynTgcGgc760.8571438816-8818
ORF1ab/nsp488C88del1C2851del1deltgCtg-750.7142868816-8818
ORF1ab/nsp488C88LC2851LnonsynTGCCTT720.2857148816-8818
ORF1ab/nsp488C88del1C2851del1delTGcC-c720.2857148816-8818
ORF1ab/nsp488C88LC2851LnonsynTGcCTc720.2857148816-8818
ORF1ab/nsp488C88LC2851LnonsynTGCCTG720.2857148816-8818
ORF1ab/nsp488C88LC2851LnonsyntGCtTG710.1428578816-8818
ORF1ab/nsp488C88GC2851GnonsynTgCGgT710.1428578816-8818
ORF1ab/nsp488C88WC2851WnonsyntgCtgG6618816-8818
ORF1ab/nsp488C88RC2851RnonsynTgcCgc650.8333338816-8818
ORF1ab/nsp488C88PC2851PnonsynTGCCCT620.3333338816-8818
ORF1ab/nsp488C88PC2851PnonsynTGCCCG620.3333338816-8818
ORF1ab/nsp488C88PC2851PnonsynTGcCCc620.3333338816-8818
ORF1ab/nsp488C88RC2851RnonsynTgCCgT610.1666678816-8818
ORF1ab/nsp488C88HC2851HnonsynTGCCAT420.58816-8818
ORF1ab/nsp488C88HC2851HnonsynTGcCAc420.58816-8818
ORF1ab/nsp488C88QC2851QnonsynTGCCAG2218816-8818
ORF1ab/nsp488C88AC2851AnonsynTGcGCc210.58816-8818
ORF1ab/nsp488C88AC2851AnonsynTGCGCT210.58816-8818

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT39193919All0.00075
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11981198B.1.1.70.001072
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT295295AE.80.144254
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT222222AY.40.000346
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT172172AY.140.015138
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT169169AY.470.005257
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT121121B.1.20.001065
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT108108B.10.000989
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT105105AY.30.001044
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT103103B.1.1340.562842
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT9898B.1.617.20.000369
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT9696AY.430.000425
ORF1ab/nsp488C88delTGC---9292All0.000018
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT6969B.1.1600.002152
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT6262AY.260.001755
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4949B.1.4290.001153
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4848AY.250.000289
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4747AY.440.000286
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4343B.1.10.00078
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT4141B.1.1.3490.42268
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3535AY.98.10.001695
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434AY.1100.003831
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434AY.46.50.006746
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT3434B.1.1.290.350515
ORF1ab/nsp488C88delTGC---2929B.1.1.70.000026
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2929B.1.3300.828571
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2828AY.1030.000174
ORF1ab/nsp488C88StGctCc2326All0.000004
ORF1ab/nsp488C88STgcAgc226All0
ORF1ab/nsp488C88StGCtCT126All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222AY.1180.001378
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222B.1.3510.000654
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2222B.1.466.20.008607
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT2020P.10.000315
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1919AY.130.003059
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818AY.750.001008
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818B.1.1.2220.003672
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1818B.1.1770.000237
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc1616All0.000003
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1616B.1.5960.001394
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.1200.000558
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1515AY.390.000371
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1414AY.290.000221
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212AY.1110.002198
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1212B.1.360.001751
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc1011All0.000002
ORF1ab/nsp488C88YtGCtAT111All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1111B.1.6390.23913
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp488C88delTGC---1010AY.40.000016
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT1010B.60.009099
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA89All0.000002
ORF1ab/nsp488C88XtGCtAG19All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99AY.50.000186
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99AY.540.000858
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99B.1.1.4340.003137
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99B.1.5820.004416
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT99P.20.00168
ORF1ab/nsp488C88del2tGCt--78All0.000001
ORF1ab/nsp488C88del2TGc--c18All0
ORF1ab/nsp488C88delTGC---88AY.430.000035
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.1.3060.003507
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT88B.1.6320.053691
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc67All0.000001
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-57All0.000001
ORF1ab/nsp488C88del1TGcC-c27All0
ORF1ab/nsp488C88LTGcCTc27All0
ORF1ab/nsp488C88LTGCCTG27All0
ORF1ab/nsp488C88LTGCCTT27All0
ORF1ab/nsp488C88LtGCtTG17All0
ORF1ab/nsp488C88GTgCGgT17All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT77AY.1210.000947
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT77AY.230.000488
ORF1ab/nsp488C88LTGCCTT260.111111
ORF1ab/nsp488C88PTGCCCG260.111111
ORF1ab/nsp488C88LTGCCTG260.111111
ORF1ab/nsp488C88LTGcCTc260.111111
ORF1ab/nsp488C88PTGcCCc260.111111
ORF1ab/nsp488C88PTGCCCT260.111111
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG66All0.000001
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc56All0.000001
ORF1ab/nsp488C88PTGCCCG26All0
ORF1ab/nsp488C88PTGCCCT26All0
ORF1ab/nsp488C88PTGcCCc26All0
ORF1ab/nsp488C88RTgCCgT16All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.120.10.001926
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.330.000401
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.1.3050.023166
ORF1ab/nsp488C88del2tGCt--56B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp488C88del2TGc--c16B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.2210.000426
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.258.170.000624
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55A.23.10.003521
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.1060.001674
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.300.001979
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp488C88StGctCc55B.10.000046
ORF1ab/nsp488C88delTGC---55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55B.1.5610.001985
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT55R.10.00045
ORF1ab/nsp488C88HTGCCAT240.111111
ORF1ab/nsp488C88HTGcCAc240.111111
ORF1ab/nsp488C88HTGCCAT24All0
ORF1ab/nsp488C88HTGcCAc24All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp488C88delTGC---44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.570.002625
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44AY.840.00175
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.2410.003247
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AU.20.007264
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp488C88delTGC---33B.10.000027
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.3180.000905
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1.4860.004732
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.1100.013575
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.50.003727
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.570.000843
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.177.70.000495
ORF1ab/nsp488C88del1TGcC-c23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.5750.00091
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG220.111111
ORF1ab/nsp488C88QTGCCAG220.111111
ORF1ab/nsp488C88delTGC---22A.20.001324
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp488C88QTGCCAG22All0
ORF1ab/nsp488C88ATGcGCc12All0
ORF1ab/nsp488C88ATGCGCT12All0
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA22AY.430.000009
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc22AY.440.000012
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.510.001818
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp488C88ATGCGCT12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88ATGcGCc12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88GTgCGgT12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88StGCtCT12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88StGctCc12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88delTGC---22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.2690.002706
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.3880.090909
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp488C88delTGC---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp488C88StGctCc22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.3460.002621
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22B.1.910.004149
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp488C88STgcAgc12D.20.000075
ORF1ab/nsp488C88StGctCc12D.20.000075
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22N.50.003534
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp488C88delTGC---22U.30.007722
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA110.055556
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11A.20.000662
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA11A.20.000662
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.100.00053
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp488C88del2tGCt--11AY.250.000006
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11AY.330.000067
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.340.000097
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc11AY.40.000002
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11AY.40.000002
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11AY.420.00004
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-11AY.430.000004
ORF1ab/nsp488C88LtGCtTG11AY.440.000006
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11AY.550.000917
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.610.000105
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-11AY.670.000464
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11AY.690.000187
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc11AY.80.000606
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG11AY.850.000427
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.890.004902
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.940.000443
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B0.000128
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA11B.10.000009
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.10.000009
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc11B.10.000009
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.1440.028571
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp488C88YtGCtAT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp488C88GTgcGgc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11B.1.1700.00431
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp488C88del2tGCt--11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.221.10.002907
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp488C88RTgcCgc11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp488C88del1tgCtg-11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.1.3290.000608
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp488C88WtgCtgG11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp488C88RTgCCgT11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp488C88STgcAgc11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp488C88XtgCtgA11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp488C88StGctCc11B.370.028571
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11B.460.020833
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11B.580.010204
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11B.6.30.026316
ORF1ab/nsp488C88XtGCtAG11C.350.000774
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11C.370.000116
ORF1ab/nsp488C88YtGctAc11D.20.000075
ORF1ab/nsp488C88delTGC---11P.10.000016
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp488C88FtGctTc11Q.80.000165
ORF1ab/nsp488C88CtgCtgT11W.10.008696