CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 50 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp450D50delD2813deldelGAT---929218702-8704

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp450D50delGAT---9292All0.000018
ORF1ab/nsp450D50delGAT---3232B.1.1.70.000029
ORF1ab/nsp450D50delGAT---66B.10.000055
ORF1ab/nsp450D50delGAT---55AY.40.000008
ORF1ab/nsp450D50delGAT---55AY.430.000022
ORF1ab/nsp450D50delGAT---33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp450D50delGAT---220.111111
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22A.20.001324
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22B.1.1.3150.016949
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp450D50delGAT---22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.590.00053
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.221.10.002907
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11C.170.055556
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11C.350.000774
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11C.360.000911
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11P.10.000016
ORF1ab/nsp450D50delGAT---11Q.80.000165