CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 435 & Codon = Tta

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4435L435LL3198LsynCtaTta21030205710.9781749857-9859

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2057121030All0.003934
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta84168418C.370.976787
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta27232783B.1.1.70.002438
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta24412441AY.630.944294
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12341245AY.40.001921
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta756775B.1.617.20.002847
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta340340C.37.10.890052
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta261262AY.460.027165
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta160230AY.30.001591
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta201229B.10.001841
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta221222AY.1030.001372
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta201202B.1.5260.004724
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta162172B.1.20.001426
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta167171AY.430.00074
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta167167AY.610.017498
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta163164B.1.5950.042537
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta131163AY.440.000797
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta153162P.10.00241
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta144145B.1.2580.009583
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta96102AY.250.000577
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta8996B.1.1600.002776
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta7588B.1.10.001361
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta8082AY.260.002265
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta8181AY.560.130016
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta7373AY.530.020989
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta7373B.1.1.2140.004048
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta6771AY.4.20.001453
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta6370B.1.1770.00083
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta5759AY.90.003853
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta4244AY.1020.001114
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta4242B.1.1400.792453
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3840AY.290.000599
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta4040AY.340.003879
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta4040B.1.1.3180.01207
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3439B.1.3510.001011
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3737B.1.36.290.019141
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3737B.1.6370.002704
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3636B.1.1.370.006943
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3131AY.1180.001942
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3131AY.470.000964
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2730AY.390.000667
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2930AY.5.40.008024
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta3030B.1.4290.000706
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2829B.1.6210.002479
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2627AY.1200.000967
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2727AY.420.001086
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2326P.1.150.005344
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2425AY.670.011142
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2424AY.330.001603
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2424B.1.221.10.069767
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1623AY.1190.000565
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2122AY.1000.000966
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2222B.1.177.600.004806
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2222B.1.5960.001917
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2222B.1.6340.075342
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2222Q.80.003628
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta2121R.10.00189
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1819AY.50.000372
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1519AY.750.00084
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1919B.1.1.2940.024051
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1719B.1.1.5190.000675
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1919B.1.2340.002507
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1919B.1.5650.015397
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1818P.30.028708
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1617AY.116.10.004983
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta217B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1616B.1.4270.000808
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1616P.20.002986
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1215B.1.360.001751
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1414B.1.36.180.005882
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1414B.1.4040.018229
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1313B.1.2210.000923
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta712AY.60.000288
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta712B.1.1.2220.001428
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1212B.1.1.630.00463
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1212B.1.177.210.000918
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1212B.1.258.170.001248
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta112B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1011AY.450.001217
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111AY.690.002053
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111AY.75.10.001983
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111AY.820.014925
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta611AY.9.20.00022
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111B.1.1.250.006254
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111B.1.1.5170.07483
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111B.1.177.750.011446
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111B.1.2430.000765
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1111B.1.4280.011224
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010AY.570.006562
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010AY.99.20.000922
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010B.1.1.3480.007962
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010B.1.3960.007057
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta310P.1.120.001452
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta1010P.1.140.000478
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta89AY.200.000311
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta89AY.540.000763
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta99AY.650.004797
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta99B.1.6230.004828
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta49Q.10.000505
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta78AY.1130.000997
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88AY.230.000558
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta28AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88AY.710.0038
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta28B0.000256
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.1.390.004077
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.214.20.004796
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.2180.041237
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.2650.010165
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.5750.002427
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta88B.1.6280.002819
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta77B.1.1.10.002287
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta77B.1.1.2840.000752
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta77B.1.1.3170.002882
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta57B.1.1.3720.003444
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta66AY.350.001398
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta46AY.360.000593
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta46B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta66P.1.10.001906
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta66P.1.60.011673
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta45AY.130.000644
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55AY.160.001898
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55AY.190.005701
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta45AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55AY.480.002326
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55AY.660.005348
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta45AY.980.000316
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55B.1.1.1890.007564
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55B.1.1.3050.019305
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta45B.1.160.140.008475
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55B.1.621.10.002529
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55B.3.10.008292
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta55C.360.004554
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta34AY.10.001187
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta34AY.1060.001005
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta34AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.320.00213
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.740.000463
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.770.00451
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44AY.850.001709
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.1.2970.008949
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.1.700.001364
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta24B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.36.380.006568
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.3770.018265
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.438.10.000429
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44B.1.4590.016327
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta34B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta34B.1.5760.00272
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44C.1.20.017021
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta44D.20.0003
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.1040.005952
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.240.001293
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.590.001589
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta23AY.680.000547
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.880.002653
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33B.1.1.1920.006928
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33B.1.1.3150.025424
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta13B.1.1.5280.004808
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33B.570.045455
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33C.140.012987
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33C.390.056604
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta33P.1.100.000808
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta23P.1.160.000748
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AP.10.003003
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.220.004184
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.270.000129
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.380.000999
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.80.001212
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12AY.920.000287
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22AY.99.10.003106
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.1.2360.013793
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.1.2800.006173
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.1.3260.003521
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.177.100.001756
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.177.550.004662
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.2100.004264
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.3320.006993
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.36.310.003503
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.3810.015625
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.5090.001732
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta12P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.20.000662
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.2.5.30.010309
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11A.30.002096
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.100.00053
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.120.000316
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.20.000356
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4435L435LCtaTta11AY.46.30.000934
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