CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 435 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4435L435delL3198deldelCTA---16716719857-9859

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---167167All0.000032
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---3333B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---2020AY.9.20.000735
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---77B.10.000064
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---77B.1.10.000127
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---55AY.40.000008
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---44B.1.1420.011594
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22AY.260.000057
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22AY.30.00002
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.1.1920.004619
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.1180.013423
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.160.80.002577
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.177.40.000422
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.350.000233
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.620.000436
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.630.000387
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.650.000533
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1.3850.004464
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1620.005025
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11B.340.013699
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11P.10.000016
ORF1ab/nsp4435L435delCTA---11Q.10.000126