CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 345 & Codon = Gtt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4345I345VI3108VnonsynAttGtt5765750.9982649587-9589

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt575576All0.00011
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt147147Q.40.066849
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt6464B.1.1.70.000057
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt6464B.1.4230.653061
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt3232AY.250.000192
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt3131AY.340.003006
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1919AY.430.000084
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1919AY.440.000116
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1515AY.1020.000398
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1313AY.470.000404
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt1010B.10.000092
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt88AY.99.20.000737
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt77Q.80.001154
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt66AY.420.000241
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt55AY.30.00005
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt55AY.330.000334
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44B.1.4970.001259
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt44P.20.000747
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt33B.1.1.4400.035294
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt33B.1.1.5250.016393
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22AY.640.00119
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22B.1.1.2650.006309
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AE.80.000489
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.260.000028
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.570.000656
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.1.4130.006897
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.1.50.008333
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.160.260.002421
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.3140.007519
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.3700.008
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11C.370.000116
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp4345I345VAttGtt11P.1.170.000162