CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 329 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4329L329delL3092deldelCTC---23623619539-9541

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---236236All0.000045
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---110110B.1.1.70.000098
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---55AY.250.00003
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---55AY.430.000022
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---33B.1.177.870.002183
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---22AY.260.000057
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11A0.000387
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1.3610.045455
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.20.004545
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.580.001332
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.258.100.011364
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11C.170.055556
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11C.350.000774
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11C.360.000911
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11P.20.000187
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp4329L329delCTC---11U.30.003861