CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 324

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4324M324IM3087InonsynatGatT42688423910.9930439524-9526
ORF1ab/nsp4324M324IM3087InonsynatGatA426881660.003888689524-9526
ORF1ab/nsp4324M324IM3087InonsynatGatC426881310.003068789524-9526
ORF1ab/nsp4324M324VM3087VnonsynAtgGtg37337319524-9526
ORF1ab/nsp4324M324delM3087deldelATG---26326319524-9526
ORF1ab/nsp4324M324TM3087TnonsynaTgaCg858519524-9526
ORF1ab/nsp4324M324LM3087LnonsynAtgTtg750.7142869524-9526
ORF1ab/nsp4324M324LM3087LnonsynAtgCtg710.1428579524-9526
ORF1ab/nsp4324M324LM3087LnonsynAtGTtA710.1428579524-9526
ORF1ab/nsp4324M324KM3087KnonsynaTgaAg5519524-9526
ORF1ab/nsp4324M324FM3087FnonsynAtGTtT2219524-9526
ORF1ab/nsp4324M324RM3087RnonsynaTgaGg2219524-9526
ORF1ab/nsp4324M324del1M3087del1delATG-AT210.59524-9526
ORF1ab/nsp4324M324del1M3087del1delatGat-210.59524-9526

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT4239142688All0.008108
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA16642688All0.000032
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC13142688All0.000025
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT3018030180B.1.1600.941243
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT16911691AY.100.896131
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT10481048B.1.160.160.973978
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT772772B.1.160.80.994845
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT597606B.10.005468
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA8606B.10.000073
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1606B.10.000009
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT585585B.1.160.170.994898
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT480480B.1.160.70.997921
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT470470B.1.160.140.995763
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT415421B.1.1.70.000372
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA5421B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1421B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT411411B.1.160.260.995157
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg373373All0.000071
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT339339B.1.160.280.991228
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT268297B.1.617.20.001009
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC23297B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA6297B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp4324M324delATG---263263All0.00005
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT243262AY.40.000378
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA18262AY.40.000028
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1262AY.40.000002
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT236236B.1.160.290.995781
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT225225B.1.160.240.995575
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT223223B.1.160.330.986726
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT206206B.1.160.230.995169
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT201201B.1.160.150.99505
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT201201B.1.160.300.598214
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT187187B.1.160.320.802575
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT173173B.1.160.110.988571
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT168171AY.30.001671
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC3171AY.30.00003
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT156156B.1.160.121
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT148148B.1.160.221
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT141141B.1.1.5280.677885
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT137137B.1.160.181
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT137137B.1.160.90.985612
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT125132AY.430.000554
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA6132AY.430.000027
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1132AY.430.000004
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT126130AY.1030.000782
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA3130AY.1030.000019
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1130AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4324M324delATG---126126B.1.1.70.000113
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT124124B.1.160.311
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT122122AB.11
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT117117B.1.160.100.943548
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg107107B.1.2580.007121
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT79100B.1.1770.00104
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA21100B.1.1770.000277
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC7090B.1.466.20.027387
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2090B.1.466.20.007825
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT8989B.1.160.250.988889
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT8788AY.440.00053
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA188AY.440.000006
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg8585All0.000016
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT7183B.1.10.001288
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA1183B.1.10.0002
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC183B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT7777B.1.160.200.6875
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT6666B.1.160.271
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT6262B.1.20.000546
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT6262B.1.2210.004404
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT5353AY.200.00206
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT4949B.1.160.211
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg4646AY.1030.000286
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT3546AY.250.000211
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA1046AY.250.00006
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC146AY.250.000006
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT3636B.1.160.131
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT3636B.1.177.440.018682
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT3333AY.140.002904
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA3030AY.120.009482
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg3030B.1.1.70.000027
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2828B.1.160.191
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2727B.1.1.390.013761
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2727B.1.1.4451
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2727B.1.6180.108871
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2627P.10.00041
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA127P.10.000016
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg2626B.1.617.10.003353
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg2323AY.1190.000812
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC1923AY.4.20.000412
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT323AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA123AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4324M324delATG---2323B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2323B.1.177.310.264368
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2222B.1.360.00321
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2121B.1.258.110.008323
ORF1ab/nsp4324M324delATG---2020AY.40.000031
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT2020AY.420.000805
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1820AY.450.00219
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA220AY.450.000243
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg1919B.1.1.2040.057751
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg1818B.1.617.20.000068
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1818B.1.619.10.011546
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1416B.1.4290.000329
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA216B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1515AY.290.000237
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1515B.1.5260.000353
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1214AY.50.000248
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC114AY.50.000021
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA114AY.50.000021
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg1414AY.680.003832
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1414AY.710.006651
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg1414B.1.1.2970.03132
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1213AY.390.000297
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA113AY.390.000025
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1213B.1.5250.001358
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA113B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1313B.1.5820.006379
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1212B.1.177.430.017725
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg1111AY.40.000017
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1111B.1.1.1890.016641
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1111B.1.177.730.006229
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1111B.1.2580.000732
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1010AY.1140.002311
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1010B0.001278
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg1010B.10.000092
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1010B.1.2180.051546
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT1010B.1.5610.00397
ORF1ab/nsp4324M324delATG---99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg99AY.440.000055
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT89AY.60.000329
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA19AY.60.000041
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT99AY.880.007958
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT99B.1.1.280.002801
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT79B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA29B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT99B.1.36.290.004656
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT78AY.1210.000947
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC18AY.1210.000135
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg88AY.250.000048
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg88AY.430.000035
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88AY.980.000632
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88B.1.1.4320.010127
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88B.1.1.700.002729
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88B.1.2600.026756
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT88B.1.617.10.001032
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg57All0.000001
ORF1ab/nsp4324M324LAtgCtg17All0
ORF1ab/nsp4324M324LAtGTtA17All0
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg77B.10.000064
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT67B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA17B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT77B.1.6090.003356
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg77B.1.9.40.042945
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT77P.20.001306
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT46AY.470.000124
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA26AY.470.000062
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT66B.1.1.340.078947
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT46B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA26B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT66B.1.5090.005195
ORF1ab/nsp4324M324KaTgaAg55All0.000001
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA45AY.1020.000106
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC15AY.1020.000027
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.360.000741
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp4324M324delATG---55AY.430.000022
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.7.10.000564
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT45AY.750.000224
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC15AY.750.000056
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55AY.870.004163
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55B.1.1530.09434
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55B.1.177.80.003762
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55B.1.4090.003906
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT55B.1.4730.096154
ORF1ab/nsp4324M324delATG---55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44AY.1180.000251
ORF1ab/nsp4324M324delATG---44AY.250.000024
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg44AY.260.000113
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg44AY.30.00004
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44AY.330.000267
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg44AY.40.000006
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg44AY.50.000083
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA44B.1.1.2970.008949
ORF1ab/nsp4324M324delATG---44B.1.177.40.000844
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp4324M324delATG---44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT34B.1.4620.021739
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC14B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44B.1.4650.015209
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA44B.1.9.40.02454
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT34C.370.000348
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA14C.370.000116
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT44R.10.00036
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.120.10.000963
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.590.001589
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.620.001307
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33AY.7.20.001678
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg33AY.750.000168
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT23AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC13AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.1.3060.001315
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.177.830.004444
ORF1ab/nsp4324M324delATG---33B.1.177.870.002183
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA33B.1.2410.002435
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.390.011719
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.3970.014563
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg33B.1.4130.012766
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.416.10.004687
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.4180.047619
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.1.4280.003061
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33B.30.002492
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA23C.360.001821
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT13C.360.000911
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg33Q.20.00184
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT33Q.80.000495
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT12A0.000387
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA12A0.000387
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22A.20.001324
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22A.23.10.001408
ORF1ab/nsp4324M324RaTgaGg22All0
ORF1ab/nsp4324M324FAtGTtT22All0
ORF1ab/nsp4324M324del1atGat-12All0
ORF1ab/nsp4324M324del1ATG-AT12All0
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.260.000057
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg22AY.390.000049
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT12AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA12AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.60.000082
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg22AY.720.002721
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22AY.740.000231
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22B.1.1.3120.003824
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.1430.042553
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp4324M324delATG---22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.177.500.00939
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.177.650.001331
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA12B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT12B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.36.220.002415
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT12B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA12B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.3780.013699
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg22B.1.4250.005988
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.4590.008163
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.5330.019231
ORF1ab/nsp4324M324KaTgaAg22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22B.1.6320.013423
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22D.20.00015
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg22N.40.008511
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT22Q.40.00091
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT110.055556
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg110.055556
ORF1ab/nsp4324M324FAtGTtT110.055556
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AE.80.000489
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AF.10.037037
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4324M324FAtGTtT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp4324M324KaTgaAg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.260.000028
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.300.000396
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.410.000294
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.510.000909
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.780.001541
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg11B.10.000009
ORF1ab/nsp4324M324del1ATG-AT11B.10.000009
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4324M324RaTgaGg11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1.1390.022727
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11B.1.1.1860.003436
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2370.005405
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.3310.011628
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.3430.020833
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1.3610.045455
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp4324M324del1atGat-11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.4820.023256
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp4324M324KaTgaAg11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1240.007812
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.20.004545
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.177.230.003236
ORF1ab/nsp4324M324KaTgaAg11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.580.001332
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.2150.009615
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.258.100.011364
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.258.120.007874
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.2680.010417
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.3090.047619
ORF1ab/nsp4324M324LAtGTtA11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.3830.009009
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.4210.007463
ORF1ab/nsp4324M324LAtgTtg11B.1.4260.001009
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.4380.006536
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11B.1.4410.009615
ORF1ab/nsp4324M324RaTgaGg11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp4324M324IatGatC11B.1.5370.02
ORF1ab/nsp4324M324IatGatA11B.1.5400.009709
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11B.1.90.006173
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.230.002924
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.400.000364
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11B.550.00295
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11C.170.055556
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11C.260.007353
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11C.350.000774
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11C.360.000911
ORF1ab/nsp4324M324TaTgaCg11C.370.000116
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11P.10.000016
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp4324M324VAtgGtg11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp4324M324IatGatT11P.30.001595
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp4324M324LAtgCtg11Q.30.000145
ORF1ab/nsp4324M324delATG---11U.30.003861