CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 311 & Codon = taT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4311Y311YY3074YsyntaCtaT1481148119485-9487

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT14811481All0.000283
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT398398B.1.1.70.000356
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT202202AY.40.000314
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT7777AY.30.000766
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT6565B.1.617.20.000245
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT6262AA.51
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT5252AY.46.40.008554
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT5050AY.800.056433
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT3838B.1.20.000335
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT3535AY.250.000211
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2626AY.440.000158
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2626B.1.1600.000811
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2222AY.390.000544
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2222B.1.3510.000654
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2121AY.1020.000557
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT2121B.1.1.10.006861
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1919AY.1030.000118
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1919B.10.000174
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1818B.1.36.80.018
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1212B.1.1770.000158
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT1010B.1.4530.032362
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT99AY.130.001449
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT99B.1.177.830.013333
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT99P.10.000142
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT88AY.1210.001083
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT88AY.340.000776
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT88AZ.10.006938
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT88B.1.4290.000188
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT77AY.50.000145
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT77AY.750.000392
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT77B.1.1.250.00398
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT66AY.39.10.000238
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT55AY.200.000194
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT55B.1.3130.032895
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT55P.20.000933
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44AY.480.00186
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44B.1.3460.005242
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44B.1.5770.002749
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44C.370.000464
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT44P.1.150.000929
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33AY.260.000085
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33AY.610.000314
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33AY.940.001328
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33B.1.1.700.001023
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33B.1.4780.035294
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT220.111111
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.230.000139
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.290.000032
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.380.000999
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.580.001815
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22C.140.008658
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22D.20.00015
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT22P.1.40.001953
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11A.250.018182
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B0.000128
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.160.330.004425
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.36.70.004
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.5110.034483
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11B.6.80.008264
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11C.160.00106
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp4311Y311YtaCtaT11P.1.80.004785