CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 307

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4307A307VA3070VnonsyngCtgTt9044904419473-9475
ORF1ab/nsp4307A307TA3070TnonsynGctAct220822070.9995479473-9475
ORF1ab/nsp4307A307TA3070TnonsynGcTAcC220810.0004528999473-9475
ORF1ab/nsp4307A307delA3070deldelGCT---23023019473-9475
ORF1ab/nsp4307A307SA3070SnonsynGctTct1871840.9839579473-9475
ORF1ab/nsp4307A307SA3070SnonsynGcTTcC18710.005347599473-9475
ORF1ab/nsp4307A307SA3070SnonsynGCtAGt18710.005347599473-9475
ORF1ab/nsp4307A307SA3070SnonsynGCTAGC18710.005347599473-9475
ORF1ab/nsp4307A307AA3070AsyngcTgcC1691300.7692319473-9475
ORF1ab/nsp4307A307AA3070AsyngcTgcG169250.1479299473-9475
ORF1ab/nsp4307A307AA3070AsyngcTgcA169140.08284029473-9475
ORF1ab/nsp4307A307del1A3070del1delgcTgc-31290.9354849473-9475
ORF1ab/nsp4307A307del1A3070del1delGct-ct3120.06451619473-9475
ORF1ab/nsp4307A307DA3070DnonsyngCtgAt101019473-9475
ORF1ab/nsp4307A307del2A3070del2delgCTg--7719473-9475
ORF1ab/nsp4307A307GA3070GnonsyngCtgGt760.8571439473-9475
ORF1ab/nsp4307A307GA3070GnonsyngCTgGC710.1428579473-9475
ORF1ab/nsp4307A307KA3070KnonsynGCTAAA3319473-9475
ORF1ab/nsp4307A307PA3070PnonsynGctCct2219473-9475
ORF1ab/nsp4307A307LA3070LnonsynGCtCTt210.59473-9475
ORF1ab/nsp4307A307LA3070LnonsynGCTTTG210.59473-9475
ORF1ab/nsp4307A307EA3070EnonsyngCTgAA1119473-9475
ORF1ab/nsp4307A307IA3070InonsynGCTATC1119473-9475
ORF1ab/nsp4307A307RA3070RnonsynGCtCGt1119473-9475

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt90449044All0.00173
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22462246AY.40.003496
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22072208All0.000422
ORF1ab/nsp4307A307TGcTAcC12208All0
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt17331733AY.1010.849926
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11321132AY.39.10.044842
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct637637B.1.1.70.00057
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt600600AY.440.003652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt565565B.1.617.20.002127
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt341341AY.30.003392
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt266266AY.1030.001652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt256256B.1.20.002254
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt249249AY.250.001498
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---230230All0.000044
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt211211AY.430.000935
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt202202AY.390.004992
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct184187All0.000035
ORF1ab/nsp4307A307SGcTTcC1187All0
ORF1ab/nsp4307A307SGCtAGt1187All0
ORF1ab/nsp4307A307SGCTAGC1187All0
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC130169All0.000025
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG25169All0.000005
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA14169All0.000003
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt130130B.1.1770.001712
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---126126B.1.1.70.000113
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct121121AY.40.000188
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt120120B.10.001099
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt115115AY.1190.00406
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt114114B.1.1.70.000102
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt109109B.1.10.001977
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt101101AY.200.003925
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt9797AY.330.006477
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt7676B.1.1600.00237
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6969AY.99.20.006359
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6161AY.1020.001617
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt6161AY.4.20.001323
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5353AY.1140.012249
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5151AY.1000.002346
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5151AY.60.002098
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt5050AY.750.002801
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt4949AY.290.000773
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct4747AY.440.000286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt4242B.1.1.10.013721
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct3838B.1.617.20.000143
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC2832B.1.1.70.000025
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA332B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG132B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-2931All0.000006
ORF1ab/nsp4307A307del1Gct-ct231All0
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2929AY.1180.001817
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2929B.1.1.330.012205
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct2828AY.430.000124
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2626B.1.1.5190.001032
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct2424B.1.10.000435
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct2424B.1.1.3690.01071
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2424B.1.2210.001705
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---2323B.1.1770.000303
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2323B.1.5750.006978
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2222AY.50.000454
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2222B.1.2340.002903
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2121AY.120.10.006742
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct2121AY.670.009749
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt2020B.1.2430.001392
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct2020B.1.5260.00047
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919AY.420.000764
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919B.1.5960.001656
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1919W.40.025676
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1818D.20.001351
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717AY.1060.005693
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717AY.4.50.001827
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1717B.1.6210.001505
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1717P.10.000268
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1616B.1.1600.000499
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1515AY.1170.001268
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1515B.1.1.5190.000596
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1414AY.30.000139
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414AY.46.60.001011
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414B0.001789
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1414B.1.2580.000932
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1313B.10.000119
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC1213B.10.00011
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG113B.10.000009
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1313B.1.1670.101562
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212AY.230.000837
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212AY.3.10.001023
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct1212AY.40.000019
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1212B.1.4290.000282
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.1200.000409
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC1011AY.40.000016
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG111AY.40.000002
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.450.001339
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1111AY.98.10.000533
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt1010All0.000002
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct1010AY.140.00088
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010AY.260.000283
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct1010B.10.000092
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt1010B.1.4970.003148
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99B.1.1.280.002801
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt99B.1.1.4340.003137
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct88AY.430.000035
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.1.177.210.000612
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.1.360.001167
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt88B.400.002914
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC88D.20.0006
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--77All0.000001
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt67All0.000001
ORF1ab/nsp4307A307GgCTgGC17All0
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.1100.000789
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct77AY.260.000198
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC67AY.430.000027
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG17AY.430.000004
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.460.000729
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.610.000733
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77AY.980.000553
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct77B.1.177.170.005747
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct77B.1.30.018325
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt77B.1.4860.777778
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.29.10.001323
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.340.000582
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66AY.350.001398
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC36B.1.10.000054
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG26B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA16B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.320.008097
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.730.003398
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.177.770.004357
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG66B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.5610.002382
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC56B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA16B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt66B.1.6230.003219
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.120.00158
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC45AY.250.000024
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG15AY.250.000006
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.740.000578
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55AY.910.003652
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.2220.00102
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.250.002843
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.1.4320.006329
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-55B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC45B.1.20.000035
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG15B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct44AY.1080.00441
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct44AY.1190.000141
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.320.00213
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG24AY.440.000012
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC24AY.440.000012
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.620.001743
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.850.001709
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44AY.960.008299
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-44B.10.000037
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.2840.00043
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.3850.017857
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.1.5210.02139
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct34B.1.20.000026
ORF1ab/nsp4307A307SGcTTcC14B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.2010.022727
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC34B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG14B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA34B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC14B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.438.10.000429
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.5770.002749
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt44B.1.840.083333
ORF1ab/nsp4307A307SGCTAGC130.055556
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct130.055556
ORF1ab/nsp4307A307SGCtAGt130.055556
ORF1ab/nsp4307A307KGCTAAA33All0.000001
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.20.001068
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33AY.250.000018
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.4.2.10.000447
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.480.001395
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.540.000286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.590.001589
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.680.000821
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.840.001312
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33AY.90.000203
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.1530.003286
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA33B.1.1.330.001263
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.3820.107143
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33B.1.1.3970.006757
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.1.80.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.130.007126
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---33B.1.177.870.002183
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG33B.1.2140.010989
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.4000.001287
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5090.002597
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5880.00273
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct33P.10.000047
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33P.1.40.00293
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt33R.10.00027
ORF1ab/nsp4307A307TGcTAcC120.055556
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt120.055556
ORF1ab/nsp4307A307GgCTgGC120.055556
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct120.055556
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22A0.000774
ORF1ab/nsp4307A307PGctCct22All0
ORF1ab/nsp4307A307LGCtCTt12All0
ORF1ab/nsp4307A307LGCTTTG12All0
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.10.000791
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22AY.190.002281
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.270.000129
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct22AY.290.000032
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct22AY.30.00002
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.390.000049
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt22AY.40.000003
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.440.000012
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22AY.450.000243
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.560.00321
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct22AY.680.000547
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22AY.7.10.000225
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.1170.019417
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.1780.083333
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.2770.001517
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.2860.005797
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22B.1.1.3120.003824
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.110.10.2
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.160.160.001859
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.160.90.014388
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.380.020833
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.650.001331
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.177.860.000367
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22B.1.2180.010309
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2500.028986
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.258.160.003273
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.2800.014286
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.30.005236
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3320.006993
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22B.1.36.260.005714
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.3910.002255
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.4090.001563
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22B.1.4680.011429
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.5550.044444
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.100.016529
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.3.10.003317
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22B.40.004415
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22B.60.00182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22C.370.000232
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22P.20.000373
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt22Q.10.000253
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct22Q.80.00033
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC110.055556
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt110.055556
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.10.000282
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.2.5.20.001572
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11A.30.002096
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4307A307EgCTgAA11All0
ORF1ab/nsp4307A307IGCTATC11All0
ORF1ab/nsp4307A307RGCtCGt11All0
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AW.10.003049
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.10.000396
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.10.000396
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp4307A307KGCTAAA11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp4307A307KGCTAAA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.120.000316
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.160.00038
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4307A307RGCtCGt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.240.000431
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.250.000006
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.260.000028
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.320.000532
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.330.000067
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.330.000067
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.410.000294
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--11AY.430.000004
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11AY.430.000004
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.450.000122
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11AY.520.000814
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.610.000105
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.700.000209
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--11AY.720.001361
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.740.000116
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.810.001992
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.920.000287
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt11B0.000128
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B0.000128
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B0.000128
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B0.000128
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B0.000128
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.10.000009
ORF1ab/nsp4307A307IGCTATC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp4307A307PGctCct11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1690.018182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1800.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.1980.001468
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2080.012195
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2400.004695
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2630.001558
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2660.012195
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp4307A307del1Gct-ct11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.1.2990.012195
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.1.3370.003597
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.1.3610.045455
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.410.006329
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4400.011765
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4470.035714
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.4580.041667
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.550.012987
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1.580.005376
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1030.019231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1080.005814
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.120.008
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1590.012195
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.160.220.006757
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.220.006757
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.280.002924
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.310.008065
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp4307A307del1Gct-ct11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.20.004545
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.30.007634
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.580.001332
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.790.002342
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1820.007246
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.1920.009259
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2110.025
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2200.01087
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.221.20.004016
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2220.001692
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2510.021739
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2540.025
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.258.240.010753
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3010.005917
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3550.011111
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.270.000763
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3710.001122
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3780.006849
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp4307A307DgCtgAt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5490.007194
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5540.004405
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5600.00463
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.5660.019231
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.6050.005952
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.6060.006024
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.6070.052632
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp4307A307KGCTAAA11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307del2gCTg--11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307EgCTgAA11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307LGCtCTt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307GgCtgGt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.1.9.50.005682
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.1.970.025641
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.110.005128
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.30.000831
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.380.02381
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA11B.400.000364
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.520.010101
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcA11B.60.00091
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11C.10.002392
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11C.10.002392
ORF1ab/nsp4307A307LGCTTTG11C.350.000774
ORF1ab/nsp4307A307SGctTct11C.370.000116
ORF1ab/nsp4307A307del1gcTgc-11D.20.000075
ORF1ab/nsp4307A307TGctAct11D.20.000075
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11P.10.000016
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcG11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp4307A307PGctCct11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp4307A307AgcTgcC11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp4307A307VgCtgTt11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp4307A307delGCT---11Q.10.000126