CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 231

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4231A231VA2994VnonsyngCtgTt990297770.9873769245-9247
ORF1ab/nsp4231A231VA2994VnonsyngCTgTA9902760.007675229245-9247
ORF1ab/nsp4231A231VA2994VnonsyngCTgTG9902460.004645539245-9247
ORF1ab/nsp4231A231VA2994VnonsyngCTgTC990230.0003029699245-9247
ORF1ab/nsp4231A231AA2994AsyngcTgcC4222570.6090059245-9247
ORF1ab/nsp4231A231AA2994AsyngcTgcA4221240.2938399245-9247
ORF1ab/nsp4231A231AA2994AsyngcTgcG422410.09715649245-9247
ORF1ab/nsp4231A231SA2994SnonsynGctTct3073050.9934859245-9247
ORF1ab/nsp4231A231SA2994SnonsynGcTTcG30720.006514669245-9247
ORF1ab/nsp4231A231GA2994GnonsyngCtgGt2011310.6517419245-9247
ORF1ab/nsp4231A231GA2994GnonsyngCTgGA201440.2189059245-9247
ORF1ab/nsp4231A231GA2994GnonsyngCTgGG201180.08955229245-9247
ORF1ab/nsp4231A231GA2994GnonsyngCTgGC20180.0398019245-9247
ORF1ab/nsp4231A231DA2994DnonsyngCtgAt14414419245-9247
ORF1ab/nsp4231A231TA2994TnonsynGctAct1291280.9922489245-9247
ORF1ab/nsp4231A231TA2994TnonsynGcTAcG12910.007751949245-9247
ORF1ab/nsp4231A231EA2994EnonsyngCTgAA94680.7234049245-9247
ORF1ab/nsp4231A231EA2994EnonsyngCTgAG94260.2765969245-9247
ORF1ab/nsp4231A231delA2994deldelGCT---414119245-9247
ORF1ab/nsp4231A231FA2994FnonsynGCtTTt242419245-9247
ORF1ab/nsp4231A231del2A2994del2delgCTg--4419245-9247
ORF1ab/nsp4231A231PA2994PnonsynGctCct430.759245-9247
ORF1ab/nsp4231A231PA2994PnonsynGcTCcG410.259245-9247
ORF1ab/nsp4231A231IA2994InonsynGCtATt2219245-9247
ORF1ab/nsp4231A231RA2994RnonsynGCtCGt210.59245-9247
ORF1ab/nsp4231A231RA2994RnonsynGCTCGG210.59245-9247
ORF1ab/nsp4231A231del1A2994del1delgCtg-t1119245-9247
ORF1ab/nsp4231A231WA2994WnonsynGCTTGG1119245-9247
ORF1ab/nsp4231A231LA2994LnonsynGCTTTG1119245-9247
ORF1ab/nsp4231A231MA2994MnonsynGCTATG1119245-9247
ORF1ab/nsp4231A231CA2994CnonsynGCtTGt1119245-9247

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt97779902All0.00187
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA769902All0.000015
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG469902All0.000009
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTC39902All0.000001
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt18871887AY.40.002937
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt17691879B.1.1.70.001584
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA671879B.1.1.70.00006
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG401879B.1.1.70.000036
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTC31879B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt10481048B.1.3670.830428
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt522522AY.1030.003241
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt481481AY.280.909263
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC257422All0.000049
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA124422All0.000024
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG41422All0.000008
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt410412B.1.617.20.001544
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA2412B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt324324B.1.220.426877
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct305307All0.000058
ORF1ab/nsp4231A231SGcTTcG2307All0
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt231232B.1.20.002034
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG1232B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt131201All0.000025
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA44201All0.000008
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG18201All0.000003
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGC8201All0.000002
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt154154AY.30.001532
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct154154AY.4.20.00334
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt144144All0.000028
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt141143B.1.1600.004397
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA1143B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG1143B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA82139B.1.1.70.000073
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC36139B.1.1.70.000032
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG21139B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt132134B.10.001209
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA2134B.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt131131AY.440.000797
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt130130AY.250.000782
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt130130AY.430.000576
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct128129All0.000024
ORF1ab/nsp4231A231TGcTAcG1129All0
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt124124B.1.1.2840.013318
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt105105B.1.3990.203095
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt9696AY.1020.002545
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA6894All0.000013
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAG2694All0.000005
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt8484B.1.5260.001974
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt8383AY.200.003226
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt8181B.1.1.70.000073
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt7878AK.10.987342
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt5476B.10.000495
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA1576B.10.000137
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGC576B.10.000046
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG276B.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA5374B.1.1.70.000047
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt4074B.1.1.70.000036
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA2174B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAG2174B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG1274B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGC174B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt7174P.10.001119
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG274P.10.000032
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA174P.10.000016
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt7171B.1.1770.000935
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC6262AY.60.00255
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt5457B.1.10.00098
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA257B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG157B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt5555B.1.4290.001294
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt5555B.1.5950.014353
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt5050AY.500.039968
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt4747B.1.3510.001397
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt4646AY.60.001892
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt4545B.1.36.270.034351
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt4242AY.290.000662
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---4141All0.000008
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt3737AY.590.019597
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC3535P.10.000551
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct3434AY.40.000053
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt3232B.1.22.11
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt3030B.1.2400.006467
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2929AY.390.000717
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2727AY.9.20.000992
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA1527B.10.000137
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC827B.10.000073
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG427B.10.000037
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC2025AY.40.000031
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG325AY.40.000005
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA225AY.40.000003
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt2424All0.000005
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2323AY.460.002394
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2222P.1.100.005928
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2121AY.4.20.000455
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2121B.1.2430.001461
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt2121B.1.4970.00661
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1919AY.260.000538
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1919B.1.2580.001264
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1919Q.10.0024
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct1818B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1717AY.470.000529
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1717C.360.015483
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt1616B.10.000147
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt1616B.1.1.3060.007014
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct1515AY.250.00009
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1515B.1.4270.000757
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1515B.4.21
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1515N.50.026502
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1414B.1.2210.000994
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1414B.1.5250.001584
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1414B.1.6090.006711
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1313AY.1190.000459
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1313B.1.1.2140.000721
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1313B.1.2340.001715
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1212AY.130.001932
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC1112AY.250.000066
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA112AY.250.000006
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC1012AY.30.000099
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG212AY.30.00002
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1212AY.740.001388
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1212B.1.5960.001046
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1212Q.80.001979
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1111AY.1180.000689
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1111AY.39.10.000436
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt1111AY.40.000017
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1010AY.650.00533
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA810B.10.000073
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAG210B.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1010B.1.1.2740.050505
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt610B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGC210B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA210B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct1010B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt99AY.50.000186
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt99AY.920.002585
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt99B.1.2650.011436
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt99B.1.4240.072581
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC99B.1.5260.000212
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt99B.1.617.10.001161
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct88AY.40.000012
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct88B.10.000073
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC88B.1.1.2630.012461
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt88B.1.1.3180.002414
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt88B.1.1.330.003367
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct88B.1.1.630.003086
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt88B.1.360.001167
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt88B.1.438.10.000858
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct88B.1.5960.000697
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt88P.1.120.003872
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77AY.1210.000947
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt77AY.250.000042
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77AY.420.000282
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct77AY.440.000043
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC47AY.440.000024
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA27AY.440.000012
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG17AY.440.000006
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77AY.75.10.001262
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77AY.9.10.000586
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77B.1.1.3980.022581
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77B.1.1.5190.000278
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct77B.1.160.310.056452
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77B.1.6370.000512
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt77R.10.00063
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.1170.000507
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.330.000401
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.400.005786
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct66AY.430.000027
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.450.00073
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66AY.530.001725
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66B0.000767
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt56B.1.10.000091
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG16B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66B.1.1.2220.001224
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC56B.1.20.000044
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA16B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66B.1.466.20.002347
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66B.1.5750.00182
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct66B.1.619.10.003849
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66C.370.000696
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct66P.10.000095
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt66Q.30.00087
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt350.166667
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG250.111111
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.230.000349
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct55AY.30.00005
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.340.000485
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.4.2.10.000745
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct55AY.450.000608
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.710.002375
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.870.004163
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55AY.90.000338
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct55B.10.000046
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55B.1.1.3970.011261
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55B.1.1.4590.076923
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55B.1.1.590.032468
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55B.1.177.600.001092
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt35B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA25B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt55P.1.140.000239
ORF1ab/nsp4231A231SGcTTcG240.111111
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct240.111111
ORF1ab/nsp4231A231del2gCTg--44All0.000001
ORF1ab/nsp4231A231PGctCct34All0.000001
ORF1ab/nsp4231A231PGcTCcG14All0
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.1050.002572
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.1110.000733
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct44AY.30.00004
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.70.000784
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct44AY.730.002661
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44AY.840.00175
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.1.390.002039
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC24B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA24B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA44B.1.177.570.001124
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.177.870.002911
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt34B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA14B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.36.10.004561
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.4360.004115
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt44B.1.4700.005618
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC44C.350.003096
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct44P.1.50.307692
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG330.166667
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33A.2.5.20.004717
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AE.80.001467
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AM.40.010714
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct33AY.1060.001005
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC33AY.140.000264
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt33AY.250.000018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.270.000194
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.29.10.000662
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC33AY.390.000074
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.410.000882
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33AY.430.000013
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.540.000286
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.560.004815
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.630.001161
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.680.000821
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.700.000626
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.750.000168
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGG13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG13B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33B.1.1.2070.003546
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.1.250.001706
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.1.3470.054545
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33B.1.1.370.000579
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.1430.06383
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.177.430.004431
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.177.730.001699
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.177.80.002257
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.177.860.00055
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.2320.001612
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA23B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC13B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.258.110.001189
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.4130.012766
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.4280.003061
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.4590.012245
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt33B.1.5060.071429
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt23B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTA13B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt33P.10.000047
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAG23P.10.000032
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA13P.10.000016
ORF1ab/nsp4231A231RGCTCGG120.055556
ORF1ab/nsp4231A231RGCtCGt120.055556
ORF1ab/nsp4231A231PGcTCcG120.055556
ORF1ab/nsp4231A231TGcTAcG120.055556
ORF1ab/nsp4231A231PGctCct120.055556
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt120.055556
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct120.055556
ORF1ab/nsp4231A231VgCTgTG120.055556
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22A.10.000564
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22A.20.001324
ORF1ab/nsp4231A231IGCtATt22All0
ORF1ab/nsp4231A231RGCTCGG12All0
ORF1ab/nsp4231A231RGCtCGt12All0
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.140.000176
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC22AY.200.000078
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.23.10.000835
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.350.000466
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---22AY.350.000466
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct22AY.390.000049
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC12AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC22AY.400.001929
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22AY.460.000208
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC22AY.470.000062
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.550.001835
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22AY.930.000546
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAG12B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA12B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.2290.011494
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.2860.005797
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp4231A231del2gCTg--22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp4231A231PGctCct22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG12B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA12B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.160.160.001859
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1700.008621
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.450.000762
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.540.001213
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.177.830.002963
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.1790.007519
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.2360.004107
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt22B.1.2650.002541
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.36.280.011494
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.36.310.003503
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.3770.009132
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.3960.001411
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.4560.006536
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.5600.009259
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt12B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp4231A231GgCTgGA12B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.5820.000981
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22B.1.6250.004706
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22C.360.001821
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22C.36.30.001134
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC22D.20.00015
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22D.20.00015
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct22D.20.00015
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22N.40.008511
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp4231A231LGCTTTG110.055556
ORF1ab/nsp4231A231CGCtTGt110.055556
ORF1ab/nsp4231A231WGCTTGG110.055556
ORF1ab/nsp4231A231MGCTATG110.055556
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt110.055556
ORF1ab/nsp4231A231IGCtATt110.055556
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11A0.000387
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11A.210.00277
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AA.70.009174
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4231A231CGCtTGt11All0
ORF1ab/nsp4231A231MGCTATG11All0
ORF1ab/nsp4231A231del1gCtg-t11All0
ORF1ab/nsp4231A231WGCTTGG11All0
ORF1ab/nsp4231A231LGCTTTG11All0
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.1150.005208
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.150.002222
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.210.001898
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.230.00007
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.240.000431
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.240.000431
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA11AY.250.000006
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG11AY.260.000028
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.290.000016
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.380.000499
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4231A231del1gCtg-t11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.430.000004
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.570.000656
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.590.00053
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.600.000938
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.670.000464
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.690.000187
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.70.000196
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.730.000665
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.750.000056
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.790.001211
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.90.000068
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.920.000287
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11AY.950.000761
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.980.000079
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231del2gCTg--11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.2670.010101
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcG11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3230.014085
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3440.010753
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3510.002793
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.4290.004608
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1.750.010638
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1130.015625
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.1260.001276
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp4231A231FGCtTTt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.160.240.004425
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.160.320.004292
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.550.002331
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.610.043478
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.710.010101
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.177.720.00339
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp4231A231IGCtATt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp4231A231EgCTgAA11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.258.70.001912
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.2600.003344
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.36.350.002604
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.3850.010638
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.4110.003704
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.4370.020833
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.4370.020833
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11B.1.4380.006536
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.4650.003802
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp4231A231del2gCTg--11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4231A231SGctTct11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.5740.002151
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp4231A231DgCtgAt11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.6340.003425
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcA11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp4231A231GgCtgGt11B.1.780.008547
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.30.000831
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp4231A231delGCT---11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.400.000364
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.60.00091
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11B.610.005747
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11C.10.002392
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11C.140.004329
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11C.180.002591
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11C.370.000116
ORF1ab/nsp4231A231TGctAct11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11P.1.40.000977
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11P.20.000187
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11P.70.004367
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11Q.20.000613
ORF1ab/nsp4231A231AgcTgcC11Q.80.000165
ORF1ab/nsp4231A231VgCtgTt11Z.10.00289