CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | D2980N | nonsyn | Gat | Aat | 19905 | 19903 | 0.9999 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | D2980N | nonsyn | GaT | AaC | 19905 | 2 | 0.000100477 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | D2980G | nonsyn | gAt | gGt | 10055 | 10053 | 0.999801 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | D2980G | nonsyn | gAT | gGC | 10055 | 1 | 0.000099453 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | D2980G | nonsyn | gAT | gGA | 10055 | 1 | 0.000099453 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | D2980A | nonsyn | gAt | gCt | 864 | 862 | 0.997685 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | D2980A | nonsyn | gAT | gCG | 864 | 1 | 0.00115741 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | D2980A | nonsyn | gAT | gCC | 864 | 1 | 0.00115741 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | D2980D | syn | gaT | gaC | 643 | 643 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | D2980H | nonsyn | Gat | Cat | 539 | 539 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | D2980Y | nonsyn | Gat | Tat | 231 | 231 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | D2980E | nonsyn | gaT | gaG | 54 | 43 | 0.796296 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | D2980E | nonsyn | gaT | gaA | 54 | 11 | 0.203704 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | D2980del | del | GAT | --- | 46 | 46 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | D2980V | nonsyn | gAt | gTt | 22 | 22 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | D2980del1 | del | gaT | ga- | 7 | 3 | 0.428571 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | D2980del1 | del | Gat | -at | 7 | 2 | 0.285714 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | D2980del1 | del | gAt | g-t | 7 | 1 | 0.142857 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | D2980del1 | del | GAt | -Gt | 7 | 1 | 0.142857 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217C | D2980C | nonsyn | GAt | TGt | 3 | 3 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217S | D2980S | nonsyn | GAt | AGt | 3 | 3 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217L | D2980L | nonsyn | GAt | CTt | 3 | 3 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del2 | D2980del2 | del | gAT | g-- | 2 | 2 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | D2980X | nonsyn | GAT | TGA | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | D2980X | nonsyn | GaT | TaA | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | D2980P | nonsyn | GAt | CCt | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | D2980P | nonsyn | GAT | CCG | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | D2980T | nonsyn | GAt | ACt | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | D2980T | nonsyn | GAT | ACC | 2 | 1 | 0.5 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217I | D2980I | nonsyn | GAt | ATt | 1 | 1 | 1 | 9203-9205 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Q | D2980Q | nonsyn | GaT | CaG | 1 | 1 | 1 | 9203-9205 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 19903 | 19905 | All | 0.003807 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | GaT | AaC | 2 | 19905 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 10053 | 10055 | All | 0.001923 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAT | gGC | 1 | 10055 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAT | gGA | 1 | 10055 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 8927 | 8927 | B.1.617.2 | 0.033614 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 6817 | 6817 | B.1.234 | 0.899459 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4171 | 4171 | AY.35 | 0.972034 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1760 | 1760 | AY.48 | 0.818605 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1745 | 1745 | C.36.3 | 0.98979 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 862 | 864 | All | 0.000165 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAT | gCG | 1 | 864 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAT | gCC | 1 | 864 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 643 | 643 | All | 0.000123 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 642 | 642 | B.1.214.2 | 0.384892 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 604 | 605 | P.3 | 0.963317 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | GaT | AaC | 1 | 605 | P.3 | 0.001595 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 593 | 593 | A.27 | 0.981788 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 587 | 587 | AY.16.1 | 0.275846 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 539 | 539 | All | 0.000103 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 518 | 518 | P.1 | 0.008161 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 438 | 438 | B.1 | 0.004012 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 327 | 327 | C.36.3.1 | 0.888587 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 325 | 325 | AY.47 | 0.010109 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 289 | 289 | B.1.1.7 | 0.000259 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 263 | 263 | B.1.1.7 | 0.000235 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 231 | 231 | All | 0.000044 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 214 | 214 | B.1.1.159 | 1 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 204 | 204 | AY.44 | 0.001242 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 174 | 174 | AY.13 | 0.02801 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 146 | 146 | B.1.2 | 0.001286 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 132 | 132 | B.1.177.16 | 0.087708 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 127 | 127 | AY.108 | 0.140022 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 118 | 118 | B.1.258 | 0.007853 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 112 | 112 | AY.23 | 0.007812 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 107 | 107 | B.1.1.7 | 0.000096 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 104 | 104 | B.1.1.7 | 0.000093 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 93 | 93 | B.1.351 | 0.002765 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 83 | 83 | AY.44 | 0.000505 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 83 | 83 | B.1.177.57 | 0.023321 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 66 | 66 | B.1.243 | 0.004593 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 65 | 65 | B.1.1.130 | 1 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 60 | 60 | AY.59 | 0.03178 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 59 | 59 | B.1 | 0.00054 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 58 | 58 | AY.92 | 0.016662 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 56 | 56 | AY.103 | 0.000348 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 43 | 54 | All | 0.000008 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 11 | 54 | All | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 50 | 50 | AY.68 | 0.013687 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 50 | 50 | AY.98 | 0.00395 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 46 | 46 | All | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 46 | 46 | AY.119 | 0.001624 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 46 | 46 | B.1.2 | 0.000405 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 45 | 45 | B.1.429 | 0.001059 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 44 | 44 | B.1.351 | 0.001308 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 40 | 40 | AY.66 | 0.042781 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 40 | 40 | B.1.596 | 0.003486 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 39 | 39 | AY.54 | 0.003719 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 35 | 35 | AY.19 | 0.039909 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 34 | 34 | B.1.1 | 0.000617 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 34 | 34 | B.1.221 | 0.002415 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 34 | 34 | B.1.617.2 | 0.000128 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 31 | 31 | AY.25 | 0.000186 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 30 | 30 | B.1.427 | 0.001515 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 29 | 29 | AY.9.2 | 0.001065 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 29 | 29 | C.36 | 0.026412 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 28 | 28 | AY.37 | 0.00885 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 27 | 27 | B.1.2 | 0.000238 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 26 | 26 | AY.52 | 0.021173 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 24 | 24 | B.1.1.7 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 24 | 24 | B.1.177 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 23 | 23 | AY.103 | 0.000143 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 22 | 22 | All | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 20 | 20 | AY.5.4 | 0.005534 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 19 | 19 | A | 0.007353 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 19 | 19 | AY.4 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 19 | 19 | AY.43 | 0.000084 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 18 | 18 | AY.116 | 0.005162 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 18 | 18 | AY.4 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 18 | 18 | AY.43 | 0.00008 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 18 | 18 | B.1.617.2 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 16 | 16 | B.1.1 | 0.00029 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 16 | 16 | B.1.617.2 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 15 | 15 | AY.4 | 0.000023 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 15 | 15 | B | 0.001917 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 15 | 15 | B.1.1.7 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 15 | 15 | B.1.2 | 0.000132 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 14 | 14 | AY.15 | 0.031111 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 14 | 14 | B.1.206 | 0.011419 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 14 | 14 | P.1 | 0.000221 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 13 | 13 | AY.3 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 12 | 12 | AY.47 | 0.000373 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 12 | 12 | B.1.1.316 | 0.011101 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 12 | 12 | B.1.1.406 | 0.077922 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 12 | 12 | B.1.177 | 0.000158 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 12 | 12 | B.1.210 | 0.025586 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 12 | 12 | B.1.517 | 0.005124 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 11 | 11 | B.1 | 0.000101 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 10 | 11 | B.1 | 0.000092 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAT | gCG | 1 | 11 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 11 | 11 | B.1.1 | 0.0002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 11 | 11 | B.1.214 | 0.040293 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 11 | 11 | B.1.236 | 0.022587 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 11 | 11 | B.1.429 | 0.000259 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 11 | 11 | B.1.639 | 0.23913 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 11 | 11 | P.1 | 0.000173 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 10 | 10 | AY.3 | 0.000099 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 10 | 10 | AY.43 | 0.000044 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 10 | 10 | B.1.1 | 0.000181 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 10 | 10 | B.1.1.10 | 0.011148 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 10 | 10 | B.1.1.222 | 0.00204 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 9 | 9 | AY.121 | 0.001218 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 9 | 9 | AY.4 | 0.000014 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 9 | 9 | AY.44 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 9 | 9 | AY.55 | 0.008257 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 9 | 9 | AY.90 | 0.00616 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 9 | 9 | B.1.36.29 | 0.004656 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 9 | 9 | B.1.564 | 0.003833 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 9 | 9 | P.1 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 8 | 8 | AY.102 | 0.000212 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 8 | 8 | AY.24 | 0.003448 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 8 | 8 | AY.25 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 8 | 8 | AY.29 | 0.000126 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 8 | 8 | AY.77 | 0.009019 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 8 | 8 | B.1.1.1 | 0.002614 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 8 | 8 | B.1.1.63 | 0.003086 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 8 | 8 | B.1.177 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 8 | 8 | B.1.177 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gaT | ga- | 3 | 7 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | Gat | -at | 2 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gAt | g-t | 1 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | GAt | -Gt | 1 | 7 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 7 | 7 | AY.4.2 | 0.000152 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | AY.62 | 0.00305 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 7 | 7 | AY.75 | 0.000392 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | AY.75 | 0.000392 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | AY.87 | 0.005828 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | AY.98.1 | 0.000339 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 7 | 7 | B.1.1 | 0.000127 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | B.1.1.294 | 0.008861 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 7 | 7 | B.1.160 | 0.000218 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 7 | 7 | B.1.214.2 | 0.004197 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 7 | 7 | B.1.258.17 | 0.000728 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | B.1.351 | 0.000208 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 7 | 7 | B.1.525 | 0.000792 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 7 | 7 | B.1.595 | 0.001827 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 7 | 7 | B.1.617.1 | 0.000903 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 7 | 7 | P.1.16 | 0.002619 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 6 | 6 | AY.102 | 0.000159 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 5 | 6 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 1 | 6 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 6 | 6 | AY.64 | 0.003571 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 6 | 6 | B.1.1.50 | 0.004073 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 4 | 6 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 2 | 6 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 6 | 6 | B.1.240 | 0.001293 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 6 | 6 | P.1.1 | 0.001906 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 6 | 6 | P.1.15 | 0.001394 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | AY.118 | 0.000313 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | AY.20 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 5 | 5 | AY.26 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 5 | 5 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 5 | 5 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | AY.56 | 0.008026 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | AY.61 | 0.000524 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 4 | 5 | B.1 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 1 | 5 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 5 | 5 | B.1.177.73 | 0.002831 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 5 | 5 | B.1.177.86 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 5 | 5 | B.1.349 | 0.003574 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 5 | 5 | B.1.497 | 0.001574 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 5 | 5 | B.1.526 | 0.000118 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | B.1.637 | 0.000365 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 5 | 5 | C.35 | 0.00387 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.100 | 0.000184 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | AY.102 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.120 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 4 | 4 | AY.25 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | AY.25 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 4 | 4 | AY.26 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.3 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | AY.39 | 0.000099 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 4 | 4 | AY.4.5 | 0.00043 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.45 | 0.000487 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | AY.74 | 0.000463 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.78 | 0.006163 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.88 | 0.003537 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | AY.9.2 | 0.000147 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | AY.98.1 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 4 | 4 | AY.99.2 | 0.000369 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | B.1.1.222 | 0.000816 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | B.1.1.39 | 0.002039 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | B.1.160 | 0.000125 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 4 | 4 | B.1.177.77 | 0.002905 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 4 | 4 | B.1.258 | 0.000266 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | B.1.396 | 0.002823 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | B.1.569 | 0.057971 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 4 | 4 | C.37 | 0.000464 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 4 | 4 | P.1 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 3 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAT | gGA | 1 | 3 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | A.29 | 0.015957 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217S | GAt | AGt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217L | GAt | CTt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217C | GAt | TGt | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 3 | 3 | AY.103 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 3 | 3 | AY.103 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 3 | 3 | AY.113 | 0.000427 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.117 | 0.000254 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | AY.119 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.22 | 0.006276 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 3 | 3 | AY.27 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.39 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 3 | 3 | AY.53 | 0.000863 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.53 | 0.000863 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.71 | 0.001425 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | AY.86 | 0.00249 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.93 | 0.000819 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | AY.95 | 0.002283 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 3 | 3 | B.1.158 | 0.071429 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 3 | 3 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.214.1 | 0.06 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | B.1.243 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.243 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 3 | 3 | B.1.258 | 0.0002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.311 | 0.000824 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.369 | 0.000856 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 3 | 3 | B.1.427 | 0.000151 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.427 | 0.000151 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.580 | 0.012195 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 3 | 3 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 2 | 3 | B.1.617.2 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 3 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | B.1.621 | 0.000266 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.1.621 | 0.000266 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 3 | 3 | B.52 | 0.030303 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 3 | 3 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 3 | 3 | P.5 | 0.041096 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217L | GAt | CTt | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217C | GAt | TGt | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | GaT | TaA | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | GAT | TGA | 1 | 2 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | A | 0.000774 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | A.2 | 0.001324 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del2 | gAT | g-- | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | GAt | CCt | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | GAT | TGA | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217X | GaT | TaA | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | GAT | CCG | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | GAt | ACt | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | GAT | ACC | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.10 | 0.00106 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.101 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.11 | 0.002677 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.116.1 | 0.000623 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.118 | 0.000125 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.12 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.120.2 | 0.002571 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.26 | 0.000057 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | AY.32 | 0.001065 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | AY.34 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.34 | 0.000194 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.37 | 0.000632 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.4 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 2 | 2 | AY.4.2 | 0.000043 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 2 | 2 | AY.4.2 | 0.000043 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.40 | 0.001929 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.43 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.47 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.61 | 0.00021 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | AY.62 | 0.000871 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.67 | 0.000929 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.70 | 0.000417 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.75.1 | 0.000361 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | AY.91 | 0.001461 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | GAT | ACC | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | GaT | AaC | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217T | GAt | ACt | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAT | gCC | 1 | 2 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | AY.99.2 | 0.000184 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B | 0.000256 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 2 | 2 | B.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | GAT | CCG | 1 | 2 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217P | GAt | CCt | 1 | 2 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.1.1 | 0.000653 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.1.372 | 0.001377 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 2 | 2 | B.1.1.39 | 0.001019 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.1.398 | 0.006452 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.1.422 | 0.090909 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.1.432 | 0.002532 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.1.524 | 0.041667 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | B.1.1.63 | 0.000772 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.1.63 | 0.000772 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del2 | gAT | g-- | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.111 | 0.00235 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 2 | 2 | B.1.160 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.177 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.177.6 | 0.001953 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.179 | 0.007519 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | B.1.221 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.284 | 0.026316 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.351 | 0.000059 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 2 | 2 | B.1.351.2 | 0.000605 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.36.10 | 0.009569 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.362.2 | 0.009434 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.367 | 0.001585 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.375 | 0.001639 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.403 | 0.006536 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.417 | 0.057143 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.459 | 0.008163 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 2 | 2 | B.1.526 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | B.1.526 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.567 | 0.006667 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.577 | 0.001375 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.581 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 2 | 2 | B.1.582 | 0.000981 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.595 | 0.000522 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.596 | 0.000174 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.637 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | B.1.637 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.1.81 | 0.042553 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | B.1.88.1 | 0.009615 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | B.3 | 0.001661 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | D.2 | 0.00015 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 2 | 2 | P.1.14 | 0.000096 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | P.1.14 | 0.000096 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | P.1.14 | 0.000096 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 2 | 2 | P.2 | 0.000373 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | Q.3 | 0.00029 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 2 | 2 | Q.8 | 0.00033 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 2 | 2 | R.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | 0.055556 | |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | A.5 | 0.001923 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217I | GAt | ATt | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Q | GaT | CaG | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AW.1 | 0.003049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.1 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.106 | 0.000335 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.110 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.114 | 0.000231 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.114 | 0.000231 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.116 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.117 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.16 | 0.00038 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.16.1 | 0.00047 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.18 | 0.010101 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.27 | 0.000065 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.28 | 0.00189 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.30 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | AY.33 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.39.1.1 | 0.000725 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gAt | g-t | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.41 | 0.000294 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217I | GAt | ATt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.51 | 0.000909 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | AY.53 | 0.000288 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.58 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.59 | 0.00053 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.77 | 0.001127 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAT | gGC | 1 | 1 | AY.78 | 0.001541 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.82 | 0.001357 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.84 | 0.000437 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | Gat | -at | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | AY.96 | 0.002075 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217S | GAt | AGt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Q | GaT | CaG | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.210 | 0.005714 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.221 | 0.010101 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.243 | 0.004082 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.1.243 | 0.004082 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.254 | 0.011236 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | B.1.1.263 | 0.001558 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.265 | 0.003155 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.291 | 0.000742 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.291 | 0.000742 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.304 | 0.002809 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.317 | 0.000412 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.388 | 0.045455 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.1.413 | 0.006897 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217S | GAt | AGt | 1 | 1 | B.1.1.420 | 0.001006 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.1.434 | 0.000349 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.434 | 0.000349 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.440 | 0.011765 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.518 | 0.006329 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.1.525 | 0.005464 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gaT | ga- | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217S | GAt | AGt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.113 | 0.015625 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.160.29 | 0.004219 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.160.31 | 0.008065 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.160.33 | 0.004425 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gaT | ga- | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.177.8 | 0.000752 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.189 | 0.004292 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217C | GAt | TGt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.214 | 0.003663 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.214.3 | 0.007143 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.232 | 0.000537 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.258.11 | 0.000396 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.265 | 0.001271 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.279 | 0.000514 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.305 | 0.002151 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaA | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217V | gAt | gTt | 1 | 1 | B.1.36.1 | 0.00114 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.36.38 | 0.001642 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.36.7 | 0.004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.371 | 0.001122 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.382 | 0.008929 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.395 | 0.007042 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.404 | 0.001302 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.1.415 | 0.014286 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.426 | 0.001009 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.436 | 0.001029 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217A | gAt | gCt | 1 | 1 | B.1.462 | 0.007246 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | B.1.462 | 0.007246 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.499 | 0.00105 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.501 | 0.007353 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.527 | 0.003704 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.537 | 0.02 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | B.1.544 | 0.006024 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.566 | 0.019231 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.575.1 | 0.002439 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.590 | 0.004545 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | Gat | -at | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | B.1.599 | 0.00365 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.600 | 0.005848 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | GAt | -Gt | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.625 | 0.002353 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.1.78 | 0.008547 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.15 | 0.017544 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del | GAT | --- | 1 | 1 | B.4.4 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | B.41 | 0.008 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217Y | Gat | Tat | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | C.16 | 0.00106 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217L | GAt | CTt | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | C.39 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | C.6 | 0.037037 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217del1 | gaT | ga- | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217H | Gat | Cat | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217D | gaT | gaC | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217G | gAt | gGt | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217E | gaT | gaG | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp4 | 217 | D217N | Gat | Aat | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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