CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 199 & Codon = Gtt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4199I199VI2962VnonsynAttGtt464619149-9151

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt4646All0.000009
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt99AY.30.00009
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt66AY.440.000037
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt55AY.40.000008
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt220.111111
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22AY.290.000032
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4199I199VAttGtt11P.1.140.000048