CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 177 & Codon = gaG

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4177E177EE2940EsyngaAgaG8137813719083-9085

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG81378137All0.001556
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG70427042B.1.20.062007
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG227227B.1.1.70.000203
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG195195B.1.5680.216667
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG111111B.1.6360.744966
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG7272B.1.360.010505
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG7070B.1.5960.0061
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG5252B.10.000476
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG4949Q.30.007107
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG3838AY.530.010926
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG3030B.1.10.000544
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG2020P.10.000315
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1818AY.440.00011
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1515AY.1030.000093
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1414AY.9.20.000514
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1313AY.700.002711
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG1212B.1.4270.000606
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG77AY.30.00007
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG77AY.430.000031
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG77B.1.1.2850.045752
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG77B.1.5750.002124
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG66B.1.1110.007051
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG55AY.1190.000177
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG55AY.470.000156
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG33AY.550.002752
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG33AY.9.10.000251
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG33B.1.4160.003807
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG33B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AD.20.000438
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AY.140.000176
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AY.260.000057
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AY.390.000049
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.177.330.003289
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.5670.006667
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22B.310.007463
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11A.50.001923
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.200.000039
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.50.000021
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11AY.790.001211
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B0.000128
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.1220.045455
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.3620.005618
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.4170.002703
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1.4620.008621
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.1820.007246
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.4200.010417
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.5500.013699
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11B.1.6390.021739
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11C.360.000911
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11C.370.000116
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11D.20.000075
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11P.20.000187
ORF1ab/nsp4177E177EgaAgaG11Q.10.000126