CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 144

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4144D144DD2907DsyngaCgaT2432137243213718984-8986
ORF1ab/nsp4144D144ND2907NnonsynGacAac6465350.8281738984-8986
ORF1ab/nsp4144D144ND2907NnonsynGaCAaT6461110.1718278984-8986
ORF1ab/nsp4144D144delD2907deldelGAC---13713718984-8986
ORF1ab/nsp4144D144GD2907GnonsyngACgGT126640.5079378984-8986
ORF1ab/nsp4144D144GD2907GnonsyngAcgGc126620.4920638984-8986
ORF1ab/nsp4144D144ED2907EnonsyngaCgaA75640.8533338984-8986
ORF1ab/nsp4144D144ED2907EnonsyngaCgaG75110.1466678984-8986
ORF1ab/nsp4144D144YD2907YnonsynGacTac25130.528984-8986
ORF1ab/nsp4144D144YD2907YnonsynGaCTaT25120.488984-8986
ORF1ab/nsp4144D144HD2907HnonsynGacCac21180.8571438984-8986
ORF1ab/nsp4144D144HD2907HnonsynGaCCaT2130.1428578984-8986
ORF1ab/nsp4144D144del1D2907del1delGac-ac20130.658984-8986
ORF1ab/nsp4144D144del1D2907del1delgaCga-2050.258984-8986
ORF1ab/nsp4144D144del1D2907del1delGaC-aT2010.058984-8986
ORF1ab/nsp4144D144del1D2907del1delgAcg-c2010.058984-8986
ORF1ab/nsp4144D144AD2907AnonsyngAcgCc1790.5294128984-8986
ORF1ab/nsp4144D144AD2907AnonsyngACgCT1760.3529418984-8986
ORF1ab/nsp4144D144AD2907AnonsyngACgCG1720.1176478984-8986
ORF1ab/nsp4144D144VD2907VnonsyngAcgTc430.758984-8986
ORF1ab/nsp4144D144RD2907RnonsynGACAGG420.58984-8986
ORF1ab/nsp4144D144RD2907RnonsynGACAGA420.58984-8986
ORF1ab/nsp4144D144VD2907VnonsyngACgTT410.258984-8986
ORF1ab/nsp4144D144XD2907XnonsynGaCTaG2218984-8986
ORF1ab/nsp4144D144KD2907KnonsynGaCAaG2218984-8986
ORF1ab/nsp4144D144ID2907InonsynGACATT1118984-8986

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT24321372432137All0.465175
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT642351642351AY.40.99977
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT224929224929B.1.617.20.846951
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT222568222568AY.430.986079
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT164789164789AY.250.991176
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT162049162049AY.440.986353
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT160277160277AY.1030.995169
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT100229100229AY.30.996917
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT6337563375AY.290.999653
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT4831748317AY.50.997708
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT4609146091AY.4.20.999653
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3987839878AY.390.985445
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3765237652AY.1020.998303
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2823028230AY.1190.996752
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2685026850AY.1200.998253
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2553825538AY.200.992538
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2508825088AY.39.10.99382
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2475424754AY.420.995856
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2430124301AY.60.999465
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2160021600AY.1000.993743
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2054320543AY.98.10.994915
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1590115901AY.1180.996178
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1485814858AY.330.992187
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1402014020AY.230.977889
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1380413804AY.46.60.996751
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1243812438AY.980.982542
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1171011710AY.3.10.99838
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1167411674AY.1170.986646
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1070610706AY.99.20.986637
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT1028910289AY.340.997673
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT94779477AY.460.986366
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT92629262AY.4.50.995593
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT88568856AY.7.10.998084
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT85698569AY.1100.96563
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT80328032AY.450.977367
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT72917291AY.1210.986604
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT69726972AY.1130.992738
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT66796679AY.360.989921
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT66726672AY.4.2.10.994041
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT60686068AY.46.40.99819
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT54405440AY.1110.996337
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT50935093AY.70.998236
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT50405040AY.46.51
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT45344534AY.29.10.999779
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT42964296AY.1140.992836
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT36383638AY.930.993446
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT35503550AY.5.40.982291
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT34443444AY.1160.987668
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT33773377AY.410.992651
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT33643364B.1.1.70.003012
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT33553355AY.920.963804
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT32033203AY.116.10.997509
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT31323132AY.120.989886
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT31093109AY.120.10.998074
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT29582958AY.1060.990623
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT29272927AY.5.30.987517
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT26162616AY.9.20.096085
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT25102510AY.10.993273
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT24392439AY.4.40.997954
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT23952395AY.23.10.999583
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT22872287AY.850.976933
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT22592259AY.840.988189
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT22532253AY.940.997344
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT21402140AY.1070.997204
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT20122012AY.1010.986758
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT20062006AY.120.2.10.999502
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT19471947AY.34.10.992861
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT18221822AY.320.970181
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT17821782AY.7.20.996644
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT14941494AY.46.20.949174
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT14681468AY.1050.944051
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT13801380AY.39.1.11
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT13771377AY.900.942505
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT13551355AY.4.10.999263
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT13461346AY.910.983199
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT13331333AY.1090.985947
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT12771277AY.950.971842
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT11781178AY.870.980849
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT11641164AY.4.30.979798
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT11591159AY.860.961826
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT11061106AY.880.977896
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT10691069AY.46.30.998133
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT958958AY.46.10.983573
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT942942AY.990.988458
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT929929AY.470.028897
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT882882AY.800.995485
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT871871AY.750.048796
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT840840AY.770.947012
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT822822AY.790.995157
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT751751AY.1080.828004
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT726726AY.120.20.933162
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT705705AY.820.956581
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT649649AY.39.21
ORF1ab/nsp4144D144NGacAac535646All0.000102
ORF1ab/nsp4144D144NGaCAaT111646All0.000021
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT640640B.10.005862
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT616616AY.730.409847
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT615615AY.99.10.954969
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT611611AY.780.941448
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT586586AY.970.996599
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT574574AY.830.989655
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT500500AY.1040.992063
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT489489AY.810.974104
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT471471AY.210.893738
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT464464AY.960.962656
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT460460AY.220.962343
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT456456AY.550.418349
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT456456AY.680.124829
ORF1ab/nsp4144D144NGacAac402402AY.130.064713
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT402402AY.5.20.990148
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT391391AY.740.045218
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT349349AY.540.033276
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT295295AY.590.15625
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT285285AY.580.258621
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT283283AY.190.322691
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT265265AY.5.10.996241
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT257257AY.75.10.04634
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT246246AY.91.11
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT221221AY.380.110334
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT219219AY.530.062967
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT206206AY.760.995169
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT203203AY.890.995098
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT195195B0.024923
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT191191AY.1150.994792
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT186186AY.520.151466
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT186186AY.690.034721
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT177177AY.620.077124
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT167167AY.640.099405
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT159159AY.100.084261
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT158158AY.670.073352
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT147147AY.370.04646
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT145145AY.560.232745
ORF1ab/nsp4144D144delGAC---137137All0.000026
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT130130AY.160.049355
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT130130AY.630.05029
ORF1ab/nsp4144D144GgACgGT64126All0.000012
ORF1ab/nsp4144D144GgAcgGc62126All0.000012
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT109109AY.570.071522
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT101101AY.130.016259
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT100100AY.400.096432
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT9999B.1.5260.002327
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT9898AY.140.008625
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT9696AY.260.002718
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT9090AY.480.04186
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT8989AY.700.018557
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT8181B.1.20.000713
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT8080AY.350.018644
ORF1ab/nsp4144D144EgaCgaA6475All0.000012
ORF1ab/nsp4144D144EgaCgaG1175All0.000002
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT6969AY.650.03678
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT6666AY.710.031354
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT6363AY.600.059099
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT5656B.1.10.001016
ORF1ab/nsp4144D144delGAC---5454B.1.1.70.000048
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT5454B.1.1600.001684
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT5252AY.110.069612
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT4141P.10.000646
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3939AY.500.031175
ORF1ab/nsp4144D144NGaCAaT3535AY.1020.000928
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3535AY.610.003667
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3333AY.490.105431
ORF1ab/nsp4144D144EgaCgaA2932AY.40.000045
ORF1ab/nsp4144D144EgaCgaG332AY.40.000005
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3131B.1.160.180.226277
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3131B.1.5960.002701
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3030AY.170.245902
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT3030AY.240.012931
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2929AY.90.00196
ORF1ab/nsp4144D144DgaCgaT2727AY.9.10.002261
ORF1ab/nsp4144D144NGaCAaT2327B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp4144D144NGacAac427B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp4144D144YGacTac1325All0.000002
ORF1ab/nsp4144D144YGaCTaT1225All0.000002
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