CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp4 : CodonNum = 137

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp4137S137LS2900LnonsyntCatTa17316173140.9998848963-8965
ORF1ab/nsp4137S137LS2900LnonsyntCAtTG1731620.00011558963-8965
ORF1ab/nsp4137S137SS2900SsyntcAtcG8758470.9688963-8965
ORF1ab/nsp4137S137SS2900SsyntcAtcT875270.03085718963-8965
ORF1ab/nsp4137S137SS2900SsyntcAtcC87510.001142868963-8965
ORF1ab/nsp4137S137delS2900deldelTCA---16216218963-8965
ORF1ab/nsp4137S137PS2900PnonsynTcaCca15715718963-8965
ORF1ab/nsp4137S137AS2900AnonsynTcaGca252518963-8965
ORF1ab/nsp4137S137TS2900TnonsynTcaAca151518963-8965
ORF1ab/nsp4137S137del1S2900del1deltcAtc-13110.8461548963-8965
ORF1ab/nsp4137S137del1S2900del1delTCa-Aa1310.07692318963-8965
ORF1ab/nsp4137S137del1S2900del1delTca-ca1310.07692318963-8965
ORF1ab/nsp4137S137XS2900XnonsyntCatAa8818963-8965
ORF1ab/nsp4137S137del2S2900del2deltCAt--320.6666678963-8965
ORF1ab/nsp4137S137del2S2900del2delTCa--a310.3333338963-8965
ORF1ab/nsp4137S137QS2900QnonsynTCaCAa1118963-8965
ORF1ab/nsp4137S137RS2900RnonsynTCACGG1118963-8965

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1731417316All0.003312
ORF1ab/nsp4137S137LtCAtTG217316All0
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa43574357AY.40.006781
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa24492451AY.630.947389
ORF1ab/nsp4137S137LtCAtTG22451AY.630.000774
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa20912091AY.50.043178
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa20742074B.1.1.70.001857
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG847875All0.000162
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT27875All0.000005
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcC1875All0
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG720720AY.250.004331
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa705705AY.30.007012
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa670670AY.250.00403
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa553553B.1.617.20.002082
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa290290AY.440.001765
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa279279B.1.3510.008294
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa224224AY.430.000992
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa222222AY.1030.001378
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa170170P.10.002678
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa168168B.1.20.001479
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---162162All0.000031
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca157157All0.00003
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa156156AY.1020.004136
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa138138B.1.1.2140.007653
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa131131AY.46.60.009459
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa128128AY.39.10.005071
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa126126B.1.1.4060.818182
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa124124AY.420.004989
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa118118AY.290.001861
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa106106AY.450.012899
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa102102AY.390.002521
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa8787AY.470.002706
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---8080B.1.1.70.000072
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa7171AY.570.046588
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa6969B.10.000632
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa6363AY.460.006557
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa6060B.1.10.001088
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa5959AY.320.031416
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa4848AY.200.001866
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa4848AY.60.001974
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa4444AY.260.001246
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa4141AY.9.20.001506
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3939P.1.140.001864
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3636B.1.5260.000846
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3535AY.410.010288
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3535B.1.1770.000461
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3535B.1.617.10.004514
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3434AY.740.003932
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3434AY.750.001905
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca3232B.1.1.70.000029
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3131AY.330.00207
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa3030B.1.1600.000936
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG1928B.1.1.70.000017
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT928B.1.1.70.000008
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2727AY.610.002829
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca2525All0.000005
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2525AY.1200.000929
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2525B.1.6210.002213
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2424AY.1170.002028
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2424AY.4.20.000521
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2323P.1.150.005344
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2222AY.1000.001012
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2222B.1.1.5190.000874
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2121B.1.2430.001461
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2020AY.560.032103
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2020AY.9.10.001674
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa2020B.1.6370.001461
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1818AY.1180.001128
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1818B.1.5960.001568
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG1617AY.1030.000099
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT117AY.1030.000006
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1717AY.1190.0006
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1717AY.690.003173
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca1717Q.30.002466
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca1515All0.000003
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1515AY.1110.002747
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1515B.1.2580.000998
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1414AY.240.006034
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1414AY.99.20.00129
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-1113All0.000002
ORF1ab/nsp4137S137del1TCa-Aa113All0
ORF1ab/nsp4137S137del1Tca-ca113All0
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG1313AY.420.000523
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1313AY.5.40.003597
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1212AY.1130.001709
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1212AY.1140.002773
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1212AY.90.000811
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG1212B.1.617.20.000045
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1212Q.80.001979
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1111AY.1060.003684
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1111AY.190.012543
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca1010AD.20.00219
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1010AY.140.00088
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca1010AY.440.000061
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa1010AY.46.40.001645
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99AY.340.000873
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99AY.46.10.00924
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99AY.46.20.005718
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG99AY.500.007194
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca99B.1.4700.01264
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa99C.370.001045
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa88All0.000002
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa88AY.1090.005917
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa88AY.4.50.00086
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---88AY.430.000035
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG88AY.440.000049
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa88AY.900.005476
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa88B.1.177.810.001515
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG88B.1.20.00007
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca88B.1.5250.000905
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa77AY.1080.007718
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca77AY.330.000467
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa77AY.360.001037
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa77AY.98.10.000339
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG67B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT17B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa66AY.230.000418
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa66AY.380.002996
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca66AY.40.000009
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca66AY.430.000027
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa66B.1.1.2160.005343
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa66B.1.4270.000303
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55A.23.10.003521
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55AY.270.000324
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG45AY.430.000018
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT15AY.430.000004
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG35B.10.000027
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT25B.10.000018
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55B.1.177.60.004883
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55B.1.258.170.00052
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55B.1.5230.012255
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55B.1.5250.000566
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca55P.10.000079
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55P.1.160.001871
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa55Q.10.000632
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.1160.001147
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.16.10.00188
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.29.10.000882
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca44AY.30.00004
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG44AY.390.000099
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.540.000381
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.910.002922
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.930.001092
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44AY.980.000316
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44B.1.1.3170.001647
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44B.1.5750.001214
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44D.20.0003
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa44P.1.120.001936
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG33AD.20.000657
ORF1ab/nsp4137S137del2tCAt--23All0
ORF1ab/nsp4137S137del2TCa--a13All0
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.130.000483
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.370.000948
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG23AY.40.000003
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcC13AY.40.000002
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.4.40.001227
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.400.002893
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.670.001393
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.710.001425
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33AY.920.000862
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca33B.10.000027
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.1.10.00098
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG33B.1.1.500.002037
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.1.500.002037
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.160.160.002788
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---33B.1.177.40.000633
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.177.860.00055
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-23B.1.20.000018
ORF1ab/nsp4137S137del1TCa-Aa13B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.258.160.00491
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.36.170.001482
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.36.70.012
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.3620.004622
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca33B.1.621.10.001517
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33B.1.6230.001609
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa33R.10.00027
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-220.111111
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.10.000791
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.120.000632
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca22AY.200.000078
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.300.000791
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT22AY.300.000791
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca22AY.40.000003
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca22AY.440.000012
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca22AY.50.000041
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.520.001629
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.530.000575
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.590.001059
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.640.00119
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.650.001066
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.700.000417
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AY.950.001522
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22AZ.20.001642
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B0.000256
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.1570.001826
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.1760.000879
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca22B.1.1.3720.001377
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.3720.001377
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.110.30.001437
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.177.460.001837
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.177.840.013333
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.2060.001631
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG22B.1.2140.007326
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.214.20.001199
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.2320.001075
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.2360.004107
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.2500.028986
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.258.220.005333
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.2650.002541
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.3200.002491
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.3320.006993
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.3400.008584
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT22B.1.351.10.076923
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.3890.002004
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.5240.002813
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.5600.009259
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.6190.001742
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.1.6340.006849
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22B.40.004415
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22P.1.100.000539
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11A0.000387
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11A.2.5.10.004808
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11A.220.066667
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11A.30.002096
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AA.50.016129
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AD.20.000219
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AE.80.000489
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AH.30.003802
ORF1ab/nsp4137S137RTCACGG11All0
ORF1ab/nsp4137S137QTCaCAa11All0
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.140.000088
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.160.00038
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.250.000006
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11AY.30.00001
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11AY.300.000396
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.350.000233
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11AY.360.000148
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11AY.390.000025
ORF1ab/nsp4137S137del1Tca-ca11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca11AY.40.000002
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.420.00004
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11AY.430.000004
ORF1ab/nsp4137S137TTcaAca11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11AY.440.000006
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11AY.460.000104
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.490.003195
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.5.20.002463
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.520.000814
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.550.000917
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.580.000907
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11AY.590.00053
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.600.000938
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11AY.680.000274
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.680.000274
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.70.000196
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.720.001361
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.730.000665
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.770.001127
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.790.001211
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.80.000606
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.820.001357
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.840.000437
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.850.000427
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.860.00083
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.880.000884
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.890.004902
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11AY.910.00073
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.950.000761
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.970.001701
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.990.001049
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11AZ.10.000867
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.10.000009
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.10.000009
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.1210.002427
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.2050.003717
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.2100.005714
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.1.3090.005848
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3370.003597
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3730.02381
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.4170.002703
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.4290.004608
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.4860.001577
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1.530.013699
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.1.1.560.017857
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4137S137del2TCa--a11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4137S137QTCaCAa11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1100.004525
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4137S137del2tCAt--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp4137S137del2tCAt--11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.480.003125
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.1.177.480.003125
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.690.001484
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.720.00339
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.220.001318
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.2420.018868
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.258.120.007874
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.2700.005618
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.36.190.009259
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.36.210.00216
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.362.20.004717
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3700.008
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3950.007042
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.4230.010204
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11B.1.5040.03125
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5400.009709
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5700.002941
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.575.10.002439
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp4137S137del1tcAtc-11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcG11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4137S137ATcaGca11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11B.1.80.001972
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11B.150.017544
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11C.160.00106
ORF1ab/nsp4137S137RTCACGG11C.350.000774
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11D.20.000075
ORF1ab/nsp4137S137XtCatAa11D.20.000075
ORF1ab/nsp4137S137StcAtcT11N.50.001767
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11P.10.000016
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11P.20.000187
ORF1ab/nsp4137S137PTcaCca11Q.10.000126
ORF1ab/nsp4137S137delTCA---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11Q.30.000145
ORF1ab/nsp4137S137LtCatTa11Q.60.006623