CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = Y801Y

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3801Y801YY1619YsyntaTtaC77177115120-5122

Details of the mutation Y801Y within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC771771All0.000147
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC513513B.1.5870.973435
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC7373B.1.1.70.000065
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC3737B.1.1600.001154
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC2323AY.590.012182
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC1919B.10.000174
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC1717B.1.177.810.003218
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC1414P.1.20.016185
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC88AY.250.000048
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC66AY.270.000388
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC44AY.330.000267
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC44AY.440.000024
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC44B.1.5950.001044
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC22P.10.000032
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AM.40.003571
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.360.000148
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.740.000116
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.5670.003333
ORF1ab/nsp3801Y801YtaTtaC11B.1.5960.000087