CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = Y1323C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31323Y1323CY2141CnonsyntAttGt17517516686-6688

Details of the mutation Y1323C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt175175All0.000033
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt5959B.1.1.70.000053
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt2222AY.250.000132
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt2222B.1.1.3450.956522
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt99AY.470.00028
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt88AY.98.10.000387
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt66B.1.177.730.003398
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt55AY.40.000008
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt44B.1.2400.000862
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt33AY.440.000018
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt33B.10.000027
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt33P.10.000047
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.680.000274
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp31323Y1323CtAttGt11P.1.70.000319