CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = V597V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3597V597VV1415VsyngtGgtT736250670.6882644508-4510
ORF1ab/nsp3597V597VV1415VsyngtGgtA736222490.3054884508-4510
ORF1ab/nsp3597V597VV1415VsyngtGgtC7362460.00624834508-4510

Details of the mutation V597V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT50677362All0.000969
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA22497362All0.00043
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC467362All0.000009
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA14401440B.1.1.500.977597
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT10201268B.1.1.70.000913
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA2471268B.1.1.70.000221
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC11268B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT492520AY.40.000766
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC23520AY.40.000036
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA5520AY.40.000008
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT262269B.1.4290.006165
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA6269B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC1269B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT238239B.1.3510.007075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC1239B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT189224AY.440.00115
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA31224AY.440.000189
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC4224AY.440.000024
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA210220B.1.4270.010604
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT10220B.1.4270.000505
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT174177AY.430.000771
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA3177AY.430.000013
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT174174B.1.1.1960.994286
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT167173B.1.617.20.000629
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA6173B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT144144B.1.1.5260.510638
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT124131B.1.20.001092
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA6131B.1.20.000053
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC1131B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT95117AY.1030.00059
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA21117AY.1030.00013
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC1117AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA112112B.1.1.2091
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT9696R.10.008641
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT6094B.10.00055
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA3094B.10.000275
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC494B.10.000037
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT8990B.1.1.2910.066073
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA190B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT7375B.1.1770.000961
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC175B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA175B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT7374AY.250.000439
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA174AY.250.000006
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5461P.10.000851
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA761P.10.00011
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5358AY.30.000527
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA458AY.30.00004
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC158AY.30.00001
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5153AY.470.001586
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA253AY.470.000062
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4552B.1.10.000816
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA752B.1.10.000127
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA4050AY.50.000826
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1050AY.50.000206
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4850B.1.1.5190.001906
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC150B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA150B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4545B.1.438.20.865385
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4444AY.99.20.004055
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4343AY.1020.00114
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3943B.1.360.00569
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC443B.1.360.000584
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3939B.1.5270.144444
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3737AY.4.50.003977
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3636AY.290.000568
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3535AY.390.000865
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2627AY.200.00101
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA127AY.200.000039
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2323B.1.221.20.092369
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2323B.1.2580.001531
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2222AY.9.20.000808
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2121B.1.1.3170.008646
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2021B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA121B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2121P.20.003919
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1920AY.330.001269
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC120AY.330.000067
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1919AY.16.10.008929
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1719B.1.1.3180.00513
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA219B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1919B.1.617.10.00245
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1818B.1.1.2560.246575
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717AY.4.2.10.002533
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717AY.460.001769
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717B.1.177.830.025185
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616AY.260.000453
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA1316B0.001662
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT316B0.000383
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616B.1.1.2140.000887
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616B.1.1.5280.076923
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616P.1.170.002588
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1415AY.98.10.000678
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA115AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414AY.1180.000877
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA914AY.270.000582
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT514AY.270.000324
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414AY.300.00554
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414B.1.2400.003018
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414B.1.4780.164706
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1313B.1.5250.001471
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.480.005581
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.650.006397
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.7.10.001352
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1112B.1.1.3060.004822
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA112B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212B.1.1.630.00463
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA1111B.1.2230.030556
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1111Q.30.001595
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT510AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA510AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1010AY.60.000411
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99AY.420.000362
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99AY.610.000943
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99B.1.466.20.003521
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99C.370.001045
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88AY.1170.000676
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88AY.1200.000297
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88B.1.2430.000557
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT77AY.1160.002007
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT77AY.90.000473
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT47B.1.6210.000354
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA37B.1.6210.000266
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT56AY.1000.00023
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA16AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.1260.007653
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.130.014252
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.3960.004234
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.1.1980.007342
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT45B.1.1.370.000771
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA15B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.2320.002687
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.3970.024272
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55P.1.60.009728
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.340.000388
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.670.001857
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.800.004515
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.3020.008299
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1700.017241
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.177.820.001909
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.2410.003247
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.3490.002859
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.3670.00317
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtC24D.20.00015
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA14D.20.000075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT14D.20.000075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44P.1.20.004624
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA33A.20.001985
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AD.20.000657
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA33AY.39.20.004622
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.400.002893
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT23AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA13AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.46.60.000217
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.510.002727
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.640.001786
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1.2580.009772
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1.4340.001046
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1030.057692
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.110.30.002155
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1890.012876
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.2150.028846
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.36.100.014354
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA33B.1.3620.004622
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.6310.010101
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.400.001093
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.10.000564
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA12AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT12AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.370.000632
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.520.001629
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.620.000871
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT12AY.750.000056
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtA12AY.750.000056
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.3040.005618
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.4480.004065
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.460.008734
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