CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = V481V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3481V481VV1299VsyngtGgtT462943840.9470734160-4162
ORF1ab/nsp3481V481VV1299VsyngtGgtA46292130.04601434160-4162
ORF1ab/nsp3481V481VV1299VsyngtGgtC4629320.006912944160-4162

Details of the mutation V481V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT43844629All0.000838
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA2134629All0.000041
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC324629All0.000006
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT937937AY.600.878987
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT499523AY.430.002211
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC16523AY.430.000071
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA8523AY.430.000035
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT454454B.1.20.003998
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT373409B.1.617.20.001404
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA35409B.1.617.20.000132
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC1409B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT305363B.1.1.70.000273
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA56363B.1.1.70.00005
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC2363B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT229243AY.40.000356
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11243AY.40.000017
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC3243AY.40.000005
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT239239AY.3.10.020377
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT158159AY.610.016555
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA1159AY.610.000105
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT7074B.10.000641
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA474B.10.000037
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT7171B.1.5210.353234
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT5259AY.1030.000323
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC459AY.1030.000025
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA359AY.1030.000019
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT4758AY.440.000286
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA1158AY.440.000067
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT5555B.1.2430.003827
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT4849AY.1020.001273
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA149AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT4849AY.9.20.001763
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA149AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT4748B.1.4270.002373
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA148B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT4545AY.75.10.008114
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT3434B.1.1.2160.030276
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2732P.10.000425
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA532P.10.000079
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT3232R.10.00288
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2829AY.30.000278
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA129AY.30.00001
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2829AY.390.000692
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC129AY.390.000025
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2727B.1.177.40.005699
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2425AY.330.001603
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC125AY.330.000067
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2323B.1.1.2190.115
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2222AY.90.001487
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT2020AJ.10.909091
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA1919AY.1130.002705
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1519AY.250.00009
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA419AY.250.000024
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1319AY.260.000368
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA619AY.260.00017
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1415AY.980.001106
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA115AY.980.000079
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1313AY.470.000404
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1112AY.1190.000388
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA112AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT912AY.200.00035
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA212AY.200.000078
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC112AY.200.000039
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1212B.1.1.3710.125
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1111AY.4.2.10.001639
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT911B.1.10.000163
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA111B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC111B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1011B.1.1770.000132
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA111B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1111B.1.230.066667
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1111B.1.5750.003337
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1010AY.39.10.000396
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1010AY.480.004651
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1010AY.550.009174
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT1010AY.650.00533
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT99AY.750.000504
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT89B.1.1.5190.000318
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA19B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT88AY.130.001288
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA88AY.360.001186
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT78AY.46.40.001152
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA18AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT88B.1.5770.005498
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT77AY.16.10.003289
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA47B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT37B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT77P.20.001306
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66AY.420.000241
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66AY.60.000247
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66B.1.5690.086957
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66B.1.5960.000523
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT66C.370.000696
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT45AY.1170.000338
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA15AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT35AY.230.000209
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA25AY.230.000139
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT55AY.240.002155
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT45AY.50.000083
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA15AY.50.000021
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA34AY.1050.001929
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT14AY.1050.000643
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT34AY.46.10.00308
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA14AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT44AY.620.001743
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT44B.1.1.5230.00625
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT23AY.460.000208
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA13AY.460.000104
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT33AY.850.001282
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT33B.1.258.170.000312
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA23B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT13B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT33B.1.6320.020134
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT33Q.40.001364
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT120.055556
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA120.055556
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA12AY.340.000097
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT12AY.340.000097
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA12AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT12AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.500.001599
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.680.000547
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.710.00095
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.730.001331
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA12AY.930.000273
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT12AY.930.000273
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22AY.950.001522
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B0.000256
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.258.30.00335
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtC22B.1.3690.00057
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA22B.1.5630.033898
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT22D.20.00015
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11A.270.001656
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.10.000396
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.170.008197
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11AY.300.000396
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.640.000595
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.970.001701
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.260.005236
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11B.1.1.3030.002762
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.5210.005348
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.2800.007143
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.36.10.00114
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.4520.013699
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.5400.009709
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtA11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp3481V481VgtGgtT11B.1.90.006173
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