CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = V404V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3404V404VV1222VsyngtTgtC270526840.9922373929-3931
ORF1ab/nsp3404V404VV1222VsyngtTgtA2705180.006654343929-3931
ORF1ab/nsp3404V404VV1222VsyngtTgtG270530.001109063929-3931

Details of the mutation V404V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC26842705All0.000513
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA182705All0.000003
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtG32705All0.000001
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC12601260B.1.1390.923754
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11751175B.1.5650.952188
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC6768B.10.000614
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA168B.10.000009
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC3434A.30.071279
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC3032B.1.1.70.000027
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA232B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC2323B0.00294
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC1919B.1.3780.130137
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC67B.1.20.000053
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtG17B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC66AY.250.000036
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA66B.1.177.440.003114
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC45B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA15B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC22AY.430.000009
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC22AY.440.000012
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA22B.1.177.150.001262
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA12B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC22P.10.000032
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC110.055556
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.330.000067
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.480.000465
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.520.000814
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtG11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA11B.1.1580.02381
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtA11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtG11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp3404V404VgtTgtC11B.1.5950.000261