CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = V300V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3300V300VV1118VsyngtCgtT969688360.9113043617-3619
ORF1ab/nsp3300V300VV1118VsyngtCgtA96968360.08622113617-3619
ORF1ab/nsp3300V300VV1118VsyngtCgtG9696240.002475253617-3619

Details of the mutation V300V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88369696All0.00169
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA8369696All0.00016
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG249696All0.000005
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT34203446B.1.1.70.003062
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA183446B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG83446B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT16181658AY.40.002518
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA401658AY.40.000062
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA602609B.1.4270.030399
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT7609B.1.4270.000353
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT335336B.1.617.20.001261
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA1336B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT252254AY.430.001116
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA2254AY.430.000009
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT153154AY.390.003781
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA1154AY.390.000025
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT154154B.1.20.001356
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT144144AY.290.002271
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT134138AY.1030.000832
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA4138AY.1030.000025
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT119124AY.440.000724
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA4124AY.440.000024
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG1124AY.440.000006
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT112112AY.260.003171
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT89109P.1.140.004254
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA20109P.1.140.000956
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT105105B.1.1.280.03268
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT97103B.10.000888
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA6103B.10.000055
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT9292AY.1020.002439
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT8790AY.50.001796
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA290AY.50.000041
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG190AY.50.000021
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA4685B.1.5260.001081
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT3885B.1.5260.000893
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG185B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT7783B.1.10.001397
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA583B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG183B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT8182AY.250.000487
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA182AY.250.000006
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT7575B.1.5230.183824
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT6870P.10.001071
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG170P.10.000016
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA170P.10.000016
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT6767R.10.006031
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT6062AY.30.000597
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA262AY.30.00002
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT4759B.1.4290.001106
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA1259B.1.4290.000282
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT4747B.1.1.2090.419643
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT4444AY.1200.001636
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT3737B.1.5750.011226
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT3333AY.1180.002067
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT3232B.1.1770.000421
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2232B.1.5960.001917
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA1032B.1.5960.000871
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT3131B.1.160.210.632653
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2930B.1.3510.000862
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA130B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2828B.1.2400.006036
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2727B.1.3110.007414
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2525B.1.1.3180.007544
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2424C.370.002786
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA2122AY.120.10.006742
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT122AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2222AY.240.009483
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2222AY.46.40.003619
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2222AY.99.20.002027
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2222B.1.177.400.113402
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2121B.1.360.003064
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT2121B.1.3670.01664
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1819AY.4.50.001935
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA119AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1919AY.60.000781
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1616AY.39.10.000634
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1515AY.450.001825
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1515B.1.258.170.00156
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414AY.470.000435
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414B.1.1.330.005892
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414B.1.177.600.003058
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT814B.1.2580.000532
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA614B.1.2580.000399
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414B.1.351.30.01227
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414B.1.6370.001023
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414P.1.70.00447
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1414W.40.018919
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1313AY.1040.025794
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1213AY.3.10.001023
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA113AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1213AY.750.000672
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA113AY.750.000056
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1313B.1.1.3060.005699
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1313P.20.002426
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1212B.1.1.5190.000477
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1212B.1.1.630.00463
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1212B.1.1600.000374
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA811AY.540.000763
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT311AY.540.000286
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1111B.1.5670.036667
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1010AY.1160.002868
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1010AY.1170.000845
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT910AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA110AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT59AY.420.000201
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA49AY.420.000161
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT89B.1.1.2220.001632
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA19B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT99B.1.4000.003861
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT99B.1.4060.054545
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG69B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT39B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT99P.1.150.002091
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88AY.1190.000282
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88AY.350.001864
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88AY.46.60.000578
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88AY.790.009685
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88AY.9.20.000294
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88B.1.1.700.002729
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88Q.10.001011
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT88Q.30.00116
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77AY.160.002658
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77AY.480.003256
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77AY.680.001916
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77B.1.1.390.003568
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77B.1.160.150.034653
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77B.1.36.80.007
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT77B.1.617.10.000903
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66AY.330.000401
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66AY.4.2.10.000894
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66AY.46.20.003812
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66AY.610.000629
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66AY.640.003571
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66B.1.177.860.001101
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66B.1.466.20.002347
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT56B.1.6280.001762
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA16B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT66C.260.044118
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT450.222222
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA150.055556
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55AY.300.001979
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55AY.460.00052
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55AY.7.10.000564
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55AY.980.000395
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55B.1.2340.00066
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT55D.20.000375
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT45P.1.10.001271
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA15P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AB.10.032787
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AY.200.000155
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AY.230.000279
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AY.4.40.001637
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AY.90.00027
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44AY.990.004197
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.1.4170.010811
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.258.140.003922
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.362.20.018868
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.438.10.000429
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.5050.017544
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT44B.1.5650.003241
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtG44B.1.6230.002146
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33A.290.015957
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.1010.001471
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.120.000948
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.4.30.002525
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.620.001307
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.70.000588
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33AY.740.000347
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.1.100.003344
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.1390.002199
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.177.450.001144
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.2060.002447
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.2650.003812
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.4360.003086
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.1.5510.003871
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT33B.390.006993
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22A0.000774
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22A.23.10.001408
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.320.001065
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.340.000194
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.360.000296
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22AY.910.001461
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B0.000256
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.1530.002191
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT12B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtA12B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp3300V300VgtCgtT22B.1.177.150.001262
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