CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = V253A

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3253V253AV1071AnonsyngTtgCt107510740.999073476-3478
ORF1ab/nsp3253V253AV1071AnonsyngTTgCG107510.0009302333476-3478

Details of the mutation V253A within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt10741075All0.000205
ORF1ab/nsp3253V253AgTTgCG11075All0
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt467467P.20.087159
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt283283AY.430.001254
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt108108B.1.1.70.000097
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt3737AY.440.000225
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt2929AY.1030.00018
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt2222B.1.10.000399
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt1919B.10.000174
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt1616B.1.20.000141
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt1414B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt99AY.40.000014
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt55AY.330.000334
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt44AY.30.00004
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt33B.1.3240.004815
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22AD.20.000438
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22AY.90.000135
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt22B.1.177.320.002699
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.110.001339
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B0.000128
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3253V253AgTTgCG11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11B.1.930.000934
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11C.350.000774
ORF1ab/nsp3253V253AgTtgCt11P.1.140.000048