CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = T970M

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3970T970MT1788MnonsynaCgaTg5234523415627-5629

Details of the mutation T970M within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg52345234All0.001001
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg900900B.1.1.70.000806
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg612612AY.40.000953
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg492492B.1.20.004332
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg441441B.1.1.5190.017513
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg425425AY.440.002587
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg268268AY.390.006623
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg180180B.1.2210.012786
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg175175B.1.617.20.000659
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg162162AY.920.046538
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg156156B.1.2430.010855
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg7575AY.430.000332
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg7070B.1.2580.004658
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg6868B.1.177.70.01121
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg6565AY.250.000391
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg4747AY.1030.000292
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg4646AY.30.000458
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg4545B.10.000412
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg4545B.1.10.000816
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg4343B.1.5960.003747
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3838C.370.00441
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3636AY.1190.001271
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3636AY.50.000743
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3333P.10.00052
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3232AY.470.000995
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg3131AY.1110.005678
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2929AY.1000.001334
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2626AY.1180.001629
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2525B.1.1770.000329
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2424AY.290.000379
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2323AY.1020.00061
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2323AY.200.000894
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2323B.1.5090.019913
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2323B.1.6210.002036
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg2222AY.4.20.000477
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1717B.1.5260.0004
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1414AY.230.000976
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1414AY.330.000935
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1414B.1.3510.000416
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1313AY.980.001027
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1212AY.450.00146
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1010B.1.438.10.001073
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg1010P.1.150.002323
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg99AY.3.10.000767
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg99B.1.1.2510.071429
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg99B.1.1.3160.008326
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg88AY.420.000322
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg88B.1.1.3180.002414
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg88B.1.5950.002088
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg77B.1.2340.000924
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg66AY.340.000582
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg66AY.610.000629
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg66B.1.1.330.002525
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg66B.1.6280.002114
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.1200.000186
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.120.10.001605
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.140.00044
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.260.000142
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.60.000206
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.700.001043
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55AY.950.003805
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55B.1.1.1760.002197
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55B.1.1.630.001929
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55B.1.36.180.002101
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg55P.1.100.001347
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44A.2.50.001996
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44AY.100.00212
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44AY.360.000593
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44AY.750.000224
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.1.1110.058824
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.1.390.002039
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.3110.001098
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44B.1.466.20.001565
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44P.1.120.001936
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg44Q.30.00058
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33A.210.00831
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33AY.1050.001929
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33AY.460.000312
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33AY.46.20.001906
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.1260.003827
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.1890.012876
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg33B.1.5770.002062
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.130.000322
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.190.002281
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.350.000466
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.640.00119
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.810.003984
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.840.000875
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.90.000135
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.1.2200.003717
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.177.570.000562
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.177.820.000955
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.4040.002604
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.4280.002041
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.5600.009259
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.1.6200.001892
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22B.520.020202
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22D.20.00015
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22P.30.00319
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22Q.80.00033
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg22R.10.00018
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11A0.000387
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.160.00038
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.300.000396
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.320.000532
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.500.000799
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.650.000533
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.660.00107
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.70.000196
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.720.001361
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.740.000116
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.770.001127
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.870.000833
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11AY.91.10.004065
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B0.000128
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.2860.002899
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.3490.010309
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.3700.012658
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1.610.008772
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.177.480.003125
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.1800.05
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.2010.005682
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.221.40.004167
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.36.190.009259
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.4200.010417
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.5370.02
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.5560.007519
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.1.9.40.006135
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11B.6.60.000889
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11N.30.005814
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11Q.20.000613
ORF1ab/nsp3970T970MaCgaTg11U.10.012821