CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = S697S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3697S697SS1515SsyntcCtcT207119630.9478514808-4810
ORF1ab/nsp3697S697SS1515SsyntcCtcA20711080.05214874808-4810

Details of the mutation S697S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT19632071All0.000375
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA1082071All0.000021
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT12791295B.1.1.70.001145
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA161295B.1.1.70.000014
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT9192AY.40.000142
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA192AY.40.000002
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT4646B.1.1.580.247312
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT3145B.10.000284
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA1445B.10.000128
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT4343B.1.5250.004866
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT4040AY.1020.001061
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT2931B.1.617.20.000109
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA231B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT2930AY.430.000128
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA130AY.430.000004
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT2829AY.440.00017
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA129AY.440.000006
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT2626AY.50.000537
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1620B.1.20.000141
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA420B.1.20.000035
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1119AY.1030.000068
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA819AY.1030.00005
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1618AY.390.000395
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA218AY.390.000049
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1617P.10.000252
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA117P.10.000016
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1016AY.250.00006
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA616AY.250.000036
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA1515B.1.2400.003233
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1414B.1.1.2840.001504
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1314B.1.1770.000171
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA114B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1212B.1.177.740.181818
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1111B.1.5230.026961
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA510B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT510B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT1010B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT79AY.30.00007
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA29AY.30.00002
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT77AY.420.000282
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66AY.46.40.000987
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66AY.610.000629
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66AZ.30.009119
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66B.1.3050.012903
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT66B.1.4080.02214
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA45AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT15AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT35B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA25B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT34AY.470.000093
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA14AY.470.000031
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT44Q.80.00066
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT330.166667
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT33AY.230.000209
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT23AY.330.000134
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA13AY.330.000067
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT33B.1.1.1270.1875
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT33B.1.2320.001612
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA33B.1.4280.003061
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA22A.210.00554
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AE.80.000978
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AV.10.010101
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.200.000078
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.260.000057
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.290.000032
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.660.002139
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.750.000112
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22AY.790.002421
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT12B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA12B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22B.1.258.30.00335
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA12B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT12B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22C.90.060606
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.280.00189
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.370.000316
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.770.001127
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B0.000128
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.4730.019231
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11C.180.002591
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcA11C.370.000116
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp3697S697StcCtcT11P.20.000187