CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = S1734del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31734S1734delS2552deldelTCA---838317919-7921

Details of the mutation S1734del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---8383All0.000016
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---3232B.1.1.70.000029
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---33B.10.000027
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---22B.1.1.2360.013793
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11A0.000387
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.258.100.011364
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11B.1.617.30.002985
ORF1ab/nsp31734S1734delTCA---11P.10.000016