CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = S1578G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31578S1578GS2396GnonsynAgtGgt6106090.9983617451-7453
ORF1ab/nsp31578S1578GS2396GnonsynAgTGgG61010.001639347451-7453

Details of the mutation S1578G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt609610All0.000116
ORF1ab/nsp31578S1578GAgTGgG1610All0
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt9999B.1.1.70.000089
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt9797AY.440.00059
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt5151AY.40.000079
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt2626P.10.00041
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt2323B.1.6200.02176
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt2222B.1.20.000194
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt2121B.1.617.20.000079
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1718B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp31578S1578GAgTGgG118B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1818B.1.3510.000535
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1616AY.9.20.000588
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1313B.10.000119
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1111AY.250.000066
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt88AY.330.000534
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt88B.1.351.20.002421
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt77AY.50.000145
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt77B.1.10.000127
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt77P.1.120.003388
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt66AY.350.001398
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt66B.1.6280.002114
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt55B.1.1.280.001556
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt55B.1.177.210.000382
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt55P.1.160.001871
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt44AY.470.000124
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt44B.1.160.160.003717
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt44P.1.100.001078
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33AY.1110.000549
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33B.1.1.5190.000119
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt33B.1.36.350.007812
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt220.111111
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22AY.140.000176
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22AY.30.00002
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22B.1.177.670.015267
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.680.000274
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.890.004902
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11AY.930.000273
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B0.000128
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.2880.001916
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.3680.003086
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.1.890.006061
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.177.460.000918
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.177.470.012987
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.5440.006024
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11B.120.00641
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11P.30.001595
ORF1ab/nsp31578S1578GAgtGgt11Q.40.000455