CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = S1314G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31314S1314GS2132GnonsynAgtGgt272627250.9996336659-6661
ORF1ab/nsp31314S1314GS2132GnonsynAgTGgA272610.0003668386659-6661

Details of the mutation S1314G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt27252726All0.000521
ORF1ab/nsp31314S1314GAgTGgA12726All0
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt685685B.1.1.70.000613
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt209209AY.460.021753
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt191191AY.440.001163
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt146146AY.40.000227
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt114114B.1.617.20.000429
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt9696AY.1030.000596
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt9595B.1.1.2320.172414
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt7373B.1.20.000643
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt7272B.1.4290.001694
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt5858B.1.4710.15847
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt5252AY.330.003472
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt5050B.10.000458
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt4747AY.710.022328
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt3939AY.430.000173
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt3636AY.260.001019
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt3333B.1.1.2140.00183
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt2828P.10.000441
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt2727AY.650.014392
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt2222AK.21
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt2222AY.250.000132
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt2121B.1.1.2410.043478
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1818AY.470.00056
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1717AY.290.000268
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1717B.1.10.000308
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1717C.36.30.009643
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1616AY.30.000159
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1616B.1.258.170.001664
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1313AY.10.005144
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1313B.1.6210.001151
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1212AY.1200.000446
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1212AY.200.000466
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1212B.1.1600.000374
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1212B.1.5960.001046
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1111AY.1000.000506
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1111AY.390.000272
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1111P.1.70.003512
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1010AY.50.000206
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt1010B.1.2580.000665
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt99AY.1020.000239
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt99B.1.2210.000639
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt88AY.1180.000501
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt88B.1.3510.000238
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt88P.1.170.001294
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt77AY.1190.000247
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt77AY.420.000282
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt77B.1.177.860.001284
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt77B.1.466.20.002739
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt66AY.690.00112
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt66B.1.1.4320.007595
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt66B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt66R.10.00054
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55AY.530.001438
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55AY.90.000338
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55AY.9.10.000419
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55B.1.1.1760.002197
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55B.1.1.3170.002058
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55C.370.00058
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt55P.1.100.001347
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.140.000352
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.450.000487
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.610.000419
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44AY.750.000224
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44B.1.2100.008529
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt44B.1.4280.004082
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33AY.230.000209
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33AY.540.000286
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.1.250.001706
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.1.3110.001074
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.1.3880.136364
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.36.80.003
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.3890.003006
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.1090.001479
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.120.000632
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.160.000759
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.370.000632
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.380.000999
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.740.000231
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.830.003448
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.880.001768
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22AY.920.000575
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.1.2740.010101
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.1.3220.017544
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.1.3890.012121
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.177.90.002663
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.258.40.006897
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.2790.001027
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.4360.002058
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.4970.00063
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.619.10.001283
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22B.1.80.003945
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22P.1.20.002312
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22P.20.000373
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22Q.10.000253
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt22Q.80.00033
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11A0.000387
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.280.00189
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.510.000909
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.550.000917
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.770.001127
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.790.001211
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.960.002075
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11AZ.50.003509
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B0.000128
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.2530.002506
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.2990.012195
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.4020.011111
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.4130.006897
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.4210.030303
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.2890.00266
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.36.330.007576
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp31314S1314GAgTGgA11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5010.007353
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5300.007143
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5340.0125
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5520.015152
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.6000.005848
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.30.000831
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11C.40.01
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11N.50.001767
ORF1ab/nsp31314S1314GAgtGgt11P.1.150.000232