CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = P503P

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3503P503PP1321PsynccAccG6834080.5973654226-4228
ORF1ab/nsp3503P503PP1321PsynccAccT6832560.3748174226-4228
ORF1ab/nsp3503P503PP1321PsynccAccC683190.02781844226-4228

Details of the mutation P503P within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG408683All0.000078
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT256683All0.000049
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC19683All0.000004
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG144149AY.40.000224
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT4149AY.40.000006
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC1149AY.40.000002
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT120120B.1.1.2140.006655
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG6569B.1.20.000572
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT469B.1.20.000035
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG5663B.1.1.70.00005
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT763B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG5253AY.430.00023
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT153AY.430.000004
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT2032B.1.10.000363
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG1032B.1.10.000181
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC232B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT2424B.1.6210.002124
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG2222B.1.1.3450.956522
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT1515AY.60.000617
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG914AY.330.000601
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT514AY.330.000334
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG1212AY.30.000119
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT711B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG311B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC111B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG66AY.420.000241
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT66AY.590.003178
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT66B.1.3510.000178
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG36B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT26B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC16B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT350.166667
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC150.055556
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG150.055556
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT45AY.1020.000106
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC15AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT35AY.1030.000019
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG15AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC15AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT35AY.250.000018
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG25AY.250.000012
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC45AY.440.000024
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG15AY.440.000006
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG35B.10.000027
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT25B.10.000018
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT23AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC13AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG23AY.450.000243
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT13AY.450.000122
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG23AY.980.000158
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT13AY.980.000079
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT22AY.790.002421
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT12B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC11AY.50.000021
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11AY.930.000273
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp3503P503PccAccT11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3503P503PccAccC11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp3503P503PccAccG11Q.10.000126