CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = N873N

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3873N873NN1691NsynaaTaaC1976197615336-5338

Details of the mutation N873N within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC19761976All0.000378
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC648648AY.39.10.025669
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC470470B.1.1.70.000421
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC9797B.1.20.000854
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC6868AY.40.000106
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC4444AY.440.000268
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC4444B.10.000403
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC4141AY.250.000247
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC3939B.1.617.20.000147
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC3838P.10.000599
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC3636AY.1030.000224
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC2727Q.10.003411
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC2222B.1.2580.001464
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC2020B.1.10.000363
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1818B.1.177.600.003932
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1616AY.430.000071
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1616B.1.1.2630.024922
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1515AY.1060.005023
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1313AY.120.004109
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1313B.1.1770.000171
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1111B.1.5820.005397
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1010B.1.2430.000696
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC1010B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC99AY.200.00035
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC88AY.540.000763
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC88B.1.1.3060.003507
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC77AY.160.002658
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC77AY.390.000173
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC77B.1.3110.001922
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC77B.1.4860.777778
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66AY.1000.000276
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66AY.1020.000159
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.1.250.003411
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.1600.000187
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.36.350.015625
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.4040.007812
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC66B.1.4740.011407
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC55AY.330.000334
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC55B.400.001821
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44AY.30.00004
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44AY.300.001583
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44AY.470.000124
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44B.1.1.2770.003035
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44B.1.370.058824
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44B.1.5970.018519
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33AY.420.000121
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33B.1.1.3480.002389
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33C.370.000348
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC33P.1.170.000485
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.450.000243
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.610.00021
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.750.000112
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22AY.980.000158
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.1.3370.007194
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.3610.002577
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.6120.005305
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22D.20.00015
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC22Q.60.013245
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.130.000161
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.620.000436
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.760.004831
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.770.001127
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.830.001724
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.890.004902
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11AY.990.001049
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B0.000128
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.2270.004348
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.2650.003155
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.3760.005952
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.3770.001381
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.258.70.001912
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.3360.002439
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.3460.001311
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.5900.004545
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3873N873NaaTaaC11Q.80.000165