CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = N291del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3291N291delN1109deldelAAT---13513513590-3592

Details of the mutation N291del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---135135All0.000026
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---2020P.10.000315
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---1919P.1.150.004414
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---1313B.1.1.70.000012
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---1010B.10.000092
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---1010P.1.120.00484
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---440.222222
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---44AY.250.000024
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---33C.370.000348
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22AY.670.000929
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.240.000431
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11B.340.013699
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp3291N291delAAT---11Q.20.000613